Экспериментальное выявление филогенетического родства некоторых таксонов

Хвощи и папоротники - монофилетические группы и самые близкие родственники к семенным растениям. Мы показываем, что существует 3 монофилетические группы сосудистых растений сохранившихся до наших дней: плауновидные (1 - Lycophyta), семенные растения (2),а также группа, имеющая общего предка (3): хвощи (Equisetophyta), псилотовые (ветвь папоротников) и все эуспоровые и лептоспоровые папоротники. Для максимального правдоподобие анализ однозначно показывает,
Это опровергает преобладающий взгляд о том, что хвощи и папоротники - переходная эволюционная стадия между мхами и семенными, и имеют роль в понимании в развитии и эволюции растений.
что хвощи (Equsetophyta, horsetail) и папоротники являются ближайшими родственниками к семенным растениям.

Оценка филогении для преобладающих групп наземных растений, каждая из которых имеет высокую морфологическую дивергенцию, была множество раз доказана и множество раз опровергнута. Мхи (печеночники, роголистники, лишайники) последовательно показаны как лежащая в основе группа, но их связь друг с другом и с сосудистыми растениями спорна. Большинство филогенетических анализов сосудистых растений последовательно восстанавливают 2 главные линии эволюции: плауновидные (Lycophytina; плауны и родственники) c 1 процентом сохранившейся разнообразия и Euphyllophytina (все остальные сосудистые растения). Сохранившиеся Euphyllophytina включают 6 главных монофилетических ветвей: хвощевые (Equisetopsida), Polypodiidae (подкласс папоротников - лептоспорангиевые) и семенные растения (Spermatophytata), Psilotidae (whisk ferns - венчиковые папоротники), мараттиевые (Marattiidae) и офиоглоссиды или ужовниковые (Ophioglossidae эуспорангиевые папоротники).

Недавние палеонтологические исследования попытались продемонстрировать, что подходы, основанные исключительно на живущих видах будут иметь трудности в реконструкции родственных связей среди главных ветвей сосудистых растений. Неадекватное разделение таксонов, гетерогеность оценки по месту ДНК нуклеотидов среди ветвей, и неподходящие алгоритмы так же существуют как факты, препятствующие пониманию древних событий разветвления.

Используя наиболее правдоподобный критерий на наборе данных из 4 комбинированных генов мы выявили наиболее правдоподобное дерево для каждого из 100 повторов. Мы также наблюдали существенно схожую топологию, используя метод наименьшей вероятности на наборе данных из 4 комбинированных генов и морфологический набор данных (три области, которые отличаются, выделены цветом). Несмотря на аналитический подход, три главные ветви возникли как монофилетические группы с исключительным результатом .Первая группа включает плауновидных (Lycophytina), значительно распознанные как особая группа сосудистых растений, только отдаленно относящаяся к другим существующим ныне папоротниковидным и семенным растениям. Другая дивергирующая ветвь соответствует семенным растениям. Третья, новая группа включает в себя все несемяпродуцирующие растения Euphyllophytina, включая также хвощевые (Equisetopsida), лептоспорангиевые (Polypodiidae) и эуспорангиевые (Marattiidae, Ophioglossidae) папоротники и whisk папоротники (Psilotidae). Семенные растения, хвощевидные и папоротники объединены как монофилетическая группа, за исключением плауновидных.