Обработка результатов гель-электрофореза

План:
Анализ результатов гель-электрофореза
Программное обеспечение для анализа и обработки изображений
Программный комплекс ImageJ

Анализ результатов гель-электрофореза
Можно выделить три основных метода детекции результатов электрофореза:
При визуальном методе гель просматривают непосредственно в УФ, субъективно оценивая результат
При фотографическом методе полученный гель фотографируют, проводя дальнейшую диагностику по фотоснимкам
При цифровом методе изображения гелей получают с помощью цифрового фотоаппарата с последующим вводом в компьютер. Метод позволяет получать изображения в реальном времени, использовать цифровую обработку изображений, а также автоматизировать процесс определения количественных показателей (напр., количество и размер ДНК в полосе свечения) и диагностики, осуществлять ведение базы данных

Чувствительность фотографического и цифрового метода детекции сопоставимы и составляют 0,1–1 нг ДНК при окрашивании ЭБ
Анализ результатов гель-электрофореза

Пакеты бесплатного программного обеспечения

Программный комплекс ImageJ
Программа ImageJ представляет собой графический редактор, позволяющий производить анализ изображений.

Программный комплекс ImageJ
ImageJ позволяет отображать, редактировать, анализировать, обрабатывать, сохранять и печатать 8-битные, 16-битные и 32-битные изображения
Комплекс может читать многие форматы изображений, такие как TIFF, PNG, GIF, JPEG, BMP, DICOM, FITS
В ImageJ можно вычислять площади, статистические показатели пиксельных значений различных выделенных областей интереса на изображениях, которые выделены вручную. Он может создавать гистограммы плотности и рисовать профили линий.
Комплекс позволяет производить различные геометрические преобразования, такие как масштабирование, поворот или отражение

Основное окно программы ImageJ
Изображение электрофоретической подвижности препаратов ДНК:
а) высокополимерной линейной ДНК, выделенной из молок лосося (IСN);
б) ДНК фага λ, расщепленной эндонуклеазой Hind III на линейные фрагменты с фиксированной длиной;
в) плазмидной ДНК pUC19

Возможности программы
Примеры выделений
Гистограмма изображения
Гистограмма изображения в табличном представлении
График профиля