Содержание
- 2. Белки и пептиды Моноизотопные массы аминокислотных остатков ADLKQLMDNEVLMAFTSYATIILAKMMFLSSATAFQRLTNKVFANPEDCAGFGKGENAKKFLRTDEKVERVRRAHLNDLENIVPFLGIGLLYSLSGPDLSTALIHFRIFVGARIYHTIAYLTPLPQPNRGLAFFVGYGVTLSMAYRLLRSRLYL (Глутатион-трансфераза человека) пептидная связь аминокислотный остаток
- 3. SAPASTTQPIGSTTSTTTKTAGATPATASGLFTIPDGDFFSTARAIVASNAVATNEDLSKIEAIWKDMKVPTDTMAQAAWDLVRHCADVGSSAQTEMIDTGPYSNGISRARLAAAIKEVCTLRQFCMKYAPVVWNWMLTNNSPPANWQAQGFKPEHKFAAFDFFNGVTNPAAIMPKEGLIRPPSEAEMNAAQTAAFVKITKARAQSNDFASLDAAVTRGRITGTTTAEAVVTLPPP (Белок оболочки Х-вируса картофеля) Пептидный фингерпринт Num From-To MH+ HPLC pI Sequence 1 1- 19
- 4. 1 определение количества того или иного белка в образце 2 идентификация белка 3 уточнение первичной структуры
- 5. Общий вопрос - что измеряется? Масс- спектрометрия – расчет молекулярной массы ионов по их поведению в
- 6. Источник ионов Система разделения ионов Детектор Общая схема масс-спектрометра MALDI ESI Времяпролетные (TOF) Квадрупольные (Q) Ионные
- 7. ESI – электрораспыление и ионизация Растворители: вода, ацетонитрил, метанол Анализируемое вещество подается в растворе через капилляр
- 8. МАТРИЦА: * Поглощает энегрию лазерного излучения, “вскипая”, увлекает в газовую фазу молекулы анализируемого вещества * Способствует
- 9. MLLTQVQTYVLSIIPSGPLKAEIAQRLEDVFAGKNTDLEVLMEWLKTRPILSPLTKGILGFVFTLTVPSERGLQRRRFVQNALNGNGDPNNMDKAVKLYRKLKREITFHGAKEISLSYSAGALASCMGLIYNRMGAVTTEVAFGLVCATCEQIADSQHRSHRQMVTTTNPLIRHENRMVLASTTAKAMEQMAGSSEQAAEAMEVASQARQMVQAMRTIGTHPSSSAGLKNDLLENLQAYQKRMGVQMQRFK Пример MALDI масс-спектра: триптический гидролизат фрагмента белка М1 вируса гриппа
- 10. Точный механизм MALDI ионизации неизвестен, однако в результате образуются, как правило, однозарядные ионы, захватившие протон либо
- 11. Пептид массой 2000 Д содержит ~ 100 углеродов в нем с вероятностью ~ 30% не встретится
- 12. * Оба метода ионизации требуют высокой химической чистоты анализируемого вещества. * Диапазон концентрации аналита при ESI
- 13. Квадрупольный анализатор Ионная ловушка Магнитный анализатор Времяпролетный масс-анализатор СИСТЕМЫ РАЗДЕЛЕНИЯ ИОНОВ
- 14. Микроканальные пластины При MALDI существует разброс по энергиям, приводящий к уширению пиков. Энергия ускорения 20 кэВ
- 15. Использование отражающего напряжения (рефлектрона Мамырина) Использование «отсрочки экстракции» вакуум Уменьшение стартового разброса ионов – повышение разрешения
- 16. Разрешение до 30 000, точность до 0.002% (=20ppm). Разрешение и точность MALDI-TOF-MS
- 17. Когда ион, захвативший избыток энергии в процессе MALDI, распадается в области свободного дрейфа, фрагменты имеют ту
- 18. для адекватного отражения дочерних ионов: U1ref/U0ref = m1/m0 набор масс-спектров с разным U рефлектрона компьютерно “сшиваются”
- 19. На верхний и нижний электроды подано постоянное положительное напряжение. На короткое время отталкивающее напряжение с верхнего
- 20. Сочетает хорошее разрешение времяпролетного масс-спектрометра с возможностью хорошего выделения (включением квадруполя) определенных ионов для получения спектров
- 21. Ионы «запираются» в мощный (7-14 тесла) секторный сверхпроводящий магнит, где вращаются под действием силы Лоренца с
- 22. Сравнение характеристик приборов
- 24. Скачать презентацию