Содержание
- 2. Лухтанов Владимир Александрович кафедра энтомологии СПбГУ отделение кариосистематики Зоологического института РАН Тел. +7(960) 2758672 [email protected]
- 3. V. Lukhtanov University of Florida: curator at the Lepidoptera collection (Palearctic butterflies) http://www.flmnh.ufl.edu/mcguire/profiles/lukhtanov.htm Harvard University: associated
- 4. CV http://www.entomology.bio.pu.ru/lukhtanov_front.htm http://www.bio.spbu.ru/staff/id110_val.php
- 5. Прогресс в науке связан с появлением и развитием новых методов научного анализа Сравнительный метод (XVIII и
- 6. генетический анализ (1865, начало XX века) выявление генетических связей между особями и популяциями Gregor Mendel (1822-1884)
- 7. Однако за рамками генетического (гибридологического) анализа остается гигантский круг проблем и биологических объектов: генетические связи существуют
- 8. Филогенетический анализ: выявление генетических (генеалогических) связей между видами и эволюционными линиями более высокого ранга
- 9. В чем отличие этого курса от других подобных? Поваренные книги (cookbooks) Серьезные монографии
- 10. http://www.tok.ro/toksite/downloads/Bioinformatika/Konyvek/konyvek%20bioinfo%20fejezetekkel%20+%20bioinfo%20konyvek/halado/Molecular%20Evolution%20A%20Phylogenetic%20Approach.pdf
- 11. Структура курса Лекции Практические занятия по освоению программ филогенетического анализа Самостоятельная работа: филогенетический анализ собственных (или
- 12. Задача курса: не просто рассказать, что можно сделать с использованием молекулярных признаков, но и показать, как
- 13. ДНК хранит информацию о плане строения организма, и эту информацию организм использует для построения самого себя.
- 14. Но эта не единственная информация, хранящаяся в ДНК и других макромолекулах, есть еще информация об истории
- 15. Документы (ДНК) Документы (ДНК) Материальные свидетельства (ископаемые формы) + + Реконструкция истории Эволюционная биология – историческая
- 16. - Что можно делать с использованием ДНК? – Расшифровывать эволюционную историю организмов!
- 17. Расшифровка истории на разных уровнях
- 18. The time will come, I believe, though I shall not live to see it, when we
- 19. Филогенетические отношения между живыми организмами (на основании анализа рибосомальной РНК)
- 20. (по: Клюге, 2000, с изменениями) Представление о филогении членистоногих, которое недавно считалось классическим: насекомые (Hexapoda) и
- 21. Молекулярная филогения членистоногих (Regier et al., 2008
- 22. Glenner H. et al. 2006 (Science, vol. 314) Происхождение насекомых: Морские раки >пресноводные раки>насекомые
- 23. даман
- 26. Прыгунчики Златокроты Даманы Трубкозуб Сирены Клада Afrotheria выделяется на основании молекулярных данных
- 27. Молекулярная систематика отряда китопарнокопытных
- 28. Происхождение человека До появления молекулярных данных После появления первых молекулярных данных
- 29. Молекулярная эволюция и филогенетика
- 30. Истрия История одной ВИЧ- инфекции (история флоридского стоматолога) (Science, 1992, 256:1165-1171)
- 31. Молекулярные филогении В систематике В молекулярной биологии В эволюционной биологии Систематика – молекулярная филогенетика ее естественная
- 32. Но и Экология, этология… да и все остальные разделы биологии Медицина, ветеринария, криминалистика и многое другое
- 33. Основные понятия филогенетики и свойства филогенетических деревьев: термины, определения, аксиомы и некоторые теоремы
- 34. Деревья (trees) «…великое Дерево Жизни заполняет земную кору своими мертвыми и сломанными ветвями и покрывает поверхность
- 35. Задача построения филогенетического дерева Математическая задача – задача комбинаторной оптимизации: на основе [биологических] данных получить дерево,
- 36. Реальные события : Признаки: Построенное дерево эволюция в природе или в например, древовидный граф, лаборатории, а.к.
- 37. Типы филогенеза
- 38. В ходе филогенеза возникают и меняются признаки. Признаки – это следы филогенеза, которые мы можем использовать
- 39. Аксиома филогенетики: Филогения таксонов и траектории эволюционных трансформаций признаков, характерных для этих таксонов, конгруэнтны
- 40. Носители нового признака могут погибнуть, и эволюционная траектория признака останется в виде точки
- 41. Филогения таксонов и траектория трансформаций признака не тождественны, однако они конгруэтны, поскольку траектория остается внутри филогении
- 42. Филогенетические траектории признаков (1 и 2) не вполне совпадают с реальной филогенией (A+B)+C Это приводит к
- 43. Поскольку траектории отдельных признаков не выходят за пределы филогении, то они конгруэнтны, и восстановлении филогении по
- 44. Дерево: основная терминология
- 45. Деревья (и их части) можно вращать в районе любого узла
- 46. “Разрешенная” и “неразрешенная” филогения Что такое “частично разрешенная филогения?”
- 47. Политомия бывает “жесткая” и “мягкая”
- 48. Представление филогении в виде дерева Графические и буквенное представления одного и того же дерева
- 49. Топология дерева — только листья, узлы, (корень) и связывающие их ветви (топология не зависит от способа
- 50. Филограмма: длина ветвей пропорциональна эволюционному расстоянию между узлами Кладограмма: представлена только топология, длина ветвей игнорируется 0.1
- 51. Филогения и ее представления в виде кладограммы, аддитивного дерева и ультраметрического дерева
- 52. Что означают горизонтальная и вертикальная оси?
- 53. Укорененное дерево Неукорененное дерево
- 55. Число таксонов (сиквенсов) и число топологий, которые можно получить на их основе Если число таксонов равно
- 56. Три способа изображения эволюционных изменений на дереве
- 57. Части дерева: группы и клады
- 58. Монофилетическая группа называется кладой Предковый таксон и ВСЕ его потомки
- 59. Монофилетический таксон = клада = ветвь = ветка = линия
- 60. Произвольное объединение двух и более терминальных таксонов
- 61. Парафилия: из явно монофилетической группы вычитаем один или более таксонов Одни считают, что это частный случай
- 62. Sauropsida
- 63. Консенсусные деревья H – human; C – chimpanzee; G – gorilla; O – orangutan; B -
- 64. H – human; C – chimpanzee; G – gorilla; O – orangutan; B - gibbon Строгий
- 66. Скачать презентацию