Методы изучения хроматина

План
Хроматин и методы его изучения
Что изучает наша лаборатория
Научная журналистика

1. Структура хроматина
Ou et al., 2017 с изменениями

Нуклеосомный уровень
«бусины на нити»
Строение нуклеосомы
гистоны

Страшные картинки
Изоформы и посттрансляционные модификации гистонов
Zhao et al., 2013

Активность хроматина
Эухроматин
активный
рыхлый
рано реплицируется
Гетерохроматин
неактивный
компактный
поздно реплицируется

Хромосомные территории
Хромосомы расположены хаотично
У каждой хромосомы своя территория
T. Cremer, M. Cremer, 2010

Хромосомные территории
UV Облучение и меченые нуклеотиды
T. Cremer, M. Cremer, 2010

Хромосомные территории в ядрах
FISH
FISH – флуоресцентная гибридизация in situ

FISH

Хромосомные территории в ядрах
FISH
FISH – флуоресцентная гибридизация in situ
T. Cremer, C. Cremer, 2001, адаптация

Мечение новой нити ДНК
Включение в новую цепь ДНК
Проявление
Азид с флуорофором
EdU – аналог тимидина

Репликативные паттерны
Эухроматин
Гетерохроматин

ТАДы и Hi-C
определение конформации хромосом
ТАДы – топологически ассоциированные домены

ТАДы и Hi-C

Регуляция транскрипции генов
транскрипция?

Регуляция транскрипции генов
транскрипция?
транскрипция!
образование петли

Укладка хроматина в ТАДы
Song, Kim, 2017, с изменениями

@sketchingscience

2. Что изучает наша лаборатория

Направления
Ядерная ламина
Когезины и репликация

Функции когезинового комплекса
контроль когезии сестринских хроматид
участие в репликации и репарации ДНК
регуляция экспрессии генов
организация хроматина в интерфазе

Поведение сестринских хроматид после репликации
Распределение репликативной метки EdU в хроматиновых фибриллах, электронная микроскопия
Deng et al., 2016
Расхождение меченого FISH локуса в клетках
Schmitz et al., 2007

Мечение сестринских
хроматид
dCas9
EGFP

Меченные dCas9‑mEGFP локусы
интерфаза
митоз

Меченные dCas9‑mEGFP локусы,
электронная микроскопия

Меченные dCas9‑mEGFP локусы в профазе,
электронная микроскопия

Причем тут когезин?..
Фундаментальная наука
Мутации в белках когезинового комплекса и его регуляторах:
Опухолевая трансформация клеток
Бесплодие и пороки развития
Когезинопатии
Зачем это вообще нужно?..

3. Научная журналистика

Как сделать научную новость

Наш редактор
Елена Клещенко

Сайт PCR.news и паблики в ВК и ФБ
Статьи на Биомолекуле про хроматин