Основы количественной и эволюционной генетики

Содержание

Слайд 2

Зачем?

Зачем?

Слайд 3

Примерный план на 1 часть (очень примерный)

Признаки – количественные и качественные
Полигенная модель
Наследуемость
Как

Примерный план на 1 часть (очень примерный) Признаки – количественные и качественные
измерять?
Отбор
Много признаков (чуть-чуть)
Что там у человека?
Геномная селекция

Слайд 4

Признаки

Количественные/Качественные
Сильно или слабовариативные
Наследуются или не наследуются

Признаки Количественные/Качественные Сильно или слабовариативные Наследуются или не наследуются …

Слайд 5

Качественные признаки глубоко в душе количественные

Качественные признаки глубоко в душе количественные

Слайд 6

Придадим немного формализма

Самый простой случай: биаллельный полиморфизм

Придадим немного формализма Самый простой случай: биаллельный полиморфизм

Слайд 7

Расщепление по одному гену

Расщепление по одному гену

Слайд 8

Расщепление в F2

Расщепление в F2

Слайд 9

Уходим от дискетности

Уходим от дискетности

Слайд 10

Формализация модели 0

Y= G + E

Формализация модели 0 Y= G + E

Слайд 11

Формализация модели 1

Формализация модели 1

Слайд 12

Формализация модели 2

Формализация модели 2

Слайд 13

И вот она

И вот она

Слайд 14

И дисперсии

И дисперсии

Слайд 15

Ключевые концепции

Ключевые концепции

Слайд 16

Дальше проще - наследуемость

Дальше проще - наследуемость

Слайд 17

Некоторые важные мисконцепции

Да/Нет
У конкретного индивида очень высокое значение признака, значит его наследуемость

Некоторые важные мисконцепции Да/Нет У конкретного индивида очень высокое значение признака, значит
очень высокая! Нет, наследуемость это характеристика популяционная, не индивида!
Наследуемость признака равна 0, значит генетика не важна для этого признака. Нет, наследуемость ничего не говорит о генетической архитектуре, только о том какая часть генетической вариативности влияет на признак
Наследуемость этой болезни равна 1, значит попытки как-то повлиять на болезнь через среду априори безрезультатны. Нет, оценки наследуемости в другой среде могут быть совершенно другими

Слайд 18

Некоторые важные мисконцепции

Да/Нет
У конкретного индивида очень высокое значение признака, значит его наследуемость

Некоторые важные мисконцепции Да/Нет У конкретного индивида очень высокое значение признака, значит
очень высокая! Нет, наследуемость это характеристика популяционная, не индивида!
Наследуемость признака равна 0, значит генетика не важна для этого признака. Нет, наследуемость ничего не говорит о генетической архитектуре, только о том какая часть генетической вариативности влияет на признак
Наследуемость этой болезни равна 1, значит попытки как-то повлиять на болезнь через среду априори безрезультатны. Нет, оценки наследуемости в другой среде могут быть совершенно другими

Слайд 19

Некоторые важные мисконцепции

Да/Нет
У конкретного индивида очень высокое значение признака, значит его наследуемость

Некоторые важные мисконцепции Да/Нет У конкретного индивида очень высокое значение признака, значит
очень высокая! Нет, наследуемость это характеристика популяционная, не индивида!
Наследуемость признака равна 0, значит генетика не важна для этого признака. Нет, наследуемость ничего не говорит о генетической архитектуре, только о том, какая часть генетической вариативности влияет на признак
Наследуемость этой болезни равна 1, значит попытки как-то повлиять на болезнь через среду априори безрезультатны. Нет, оценки наследуемости в другой среде могут быть совершенно другими

Слайд 20

Некоторые важные мисконцепции

Да/Нет
У конкретного индивида очень высокое значение признака, значит его наследуемость

Некоторые важные мисконцепции Да/Нет У конкретного индивида очень высокое значение признака, значит
очень высокая! Нет, наследуемость это характеристика популяционная, не индивида!
Наследуемость признака равна 0, значит генетика не важна для этого признака. Нет, наследуемость ничего не говорит о генетической архитектуре, только о том, какая часть генетической вариативности влияет на признак
Наследуемость этой болезни равна 1, значит попытки как-то повлиять на болезнь через среду априори безрезультатны. Нет, оценки наследуемости в другой среде могут быть совершенно другими

Слайд 21

Как оценивать?

В общем случае: родственная структура – чем больше родственники похожи по

Как оценивать? В общем случае: родственная структура – чем больше родственники похожи
определённому фенотипу – тем больше его наследуемость
Близнецовые исследования – «лучшие»:
МБ (MZ) – 100% генов одинаковые, дисперсия только средовая
ДБ (DZ) – 50% генов общие, вклад в дисперсию признака как от генов, так и от среды

Слайд 22

Близнецовые исследования

Близнецовые исследования

Слайд 23

Аддитивность и неаддитивность

Аддитивность и неаддитивность

Слайд 24

Отбор

Selection can change the distribution of phenotypes, and we typically measure this

Отбор Selection can change the distribution of phenotypes, and we typically measure
by changes in mean
– This is a within-generation change
Selection can also change the distribution of breeding values
- This is the response to selection, the change in the trait in the next generation (the between generation change

Слайд 25

The Selection Differential and the Response to Selection

The selection differential S measures the

The Selection Differential and the Response to Selection The selection differential S
within-generation change in the mean
S = μ* - μ
The response R is the between-generation change in the mean
R(t) = μ(t+1) - μ(t)

Слайд 27

The Breeders’ Equation: translating S into R

The Breeders’ Equation: translating S into R

Слайд 29

Средний эффект аллеля

Средний эффект аллеля