Физиология микроорганизмов

ЛИТЕРАТУРА
Основная
Готтшалк, Г. Метаболизм бактерий / Г. Готтшалк. М.: Мир, 1982.
Гусев, М. В. Микробиология / М. В. Гусев, Л. А. Минеева. М. :
Издательский центр «Академия», 2003.
Лысак, В. В. Микробиология / В. В. Лысак. Минск : БГУ, 2008.
Современная микробиология Прокариоты: В 2-х т. / под ред.
Й. Ленгелера, Г. Древса, Г. Г. Шлегеля. М.: Мир, 2005.
Шлегель, Г. Общая микробиология / Г. Шлегель. М. : Мир, 1987.
Лекции по курсу «Физиология микроорганизмов». Лектор доцент Лысак В.В.

ЛИТЕРАТУРА
Дополнительная
Белясова, Н.А. Микробиология / Н.А. Белясова. Минск: Выш. шк., 2012.
Гутина, В.Н. Очерки по истории физиологии микроорганизмов / В.Н.
Гутина. М.: Наука, 1988.
Емцев, В.Т. Микробиология / В.Т. Емцев, Е.Н. Мишустин. М.: Дрофа, 2005.
Работнова И.Л. История и перспективы общей физиологии микро-
организмов / И.Л. Работнова. М.: МаксПресс, 2012.
Стейниер, Р. Мир микробов: в 3 т. / Р. Стейниер, Э. Эдельберг, Дж. Ингрэм. М.: Мир, 1979.
Шлегель, Г. История микробиологии /Г. Шлегель. М.: Едиториал У РСС, 2002.
Лекции по курсу «Физиология микроорганизмов». Лектор доцент Лысак В.В.

Лекции по курсу «Физиология микроорганизмов». Лектор доцент Лысак В.В.

Питание микроорганизмов
Питание микроорганизмов – включение в метаболические реакции любого характера тех или иных соединений внешней среды.
Все химические элементы, необходимые для жизнедеятельности микроорганизмов, подразделяют на макро- и микроэлементы. К основным макроэлементам, из которых состоят биополимеры микроорганизмов, относятся С, О, Н, N, P, S.
Кроме того, для построения клеток необходимы важные в качестве электролитов щелочные металлы (К, Na), щелочноземельные металлы (Mg, Ca), выполняющие функции кофакторов ферментов.
Лекции по курсу «Физиология микроорганизмов». Лектор доцент Лысак В.В.

Питание микроорганизмов
К микроэлементам относятся металлы переходной группы (V, Mn, Fe, Co, Ni, Cu, Zn, Mo, Wo) и неметаллы (Se, B, Cl и др.). Некоторые из микроэлементов встречаются в форме оксианионов, таких как SeO3- (селенит), WoO42- (вольфрамат) и MoО42- (молибдат). В клетках микроорганизмов они подвергаются ферментативному восстановлению, приобретая валентность, необходимую для ассимиляции.
Далее в таблице представлены физиологические группы питания микроорганизмов.
Лекции по курсу «Физиология микроорганизмов». Лектор доцент Лысак В.В.

Лекции по курсу «Физиология микроорганизмов». Лектор доцент Лысак В.В.

Лекции по курсу «Физиология микроорганизмов». Лектор доцент Лысак В.В.

Механизмы, обеспечивающие детоксикацию сильных окислителей у аэробных микроорганизмов
Многие клетки синтезируют ферменты каталазу и пероксидазу, защищающие их содержимое от токсичного действия радикалов кислорода:
Супероксиды разлагаются под действием супероксиддисмутазы:
Лекции по курсу «Физиология микроорганизмов». Лектор доцент Лысак В.В.

Источники азота для микроорганизмов
Одним из основных элементов, из которых построены клетки микроорганизмов, является азот. Большинство микроорганизмов по-требляют азот в востановленной форме. Окисленные формы азота также могут усваиваться различными группами микроорганизмов. Некоторые бактерии способны использовать атмосферный азот.
Среди азотфиксирующих микроорганизмов выделяют как свободноживущие (бактерии родов Azotobacter, Azomonas, Beijerinсkia, Derxia, Azospirillum, некоторые виды родов Clostridium, Klebsiella, Pseudomonas, некоторые цианобактерии, пурпурные бактерии и зеленые серные бактерии и др.), так и симбиотические (бактерии родов Rhizobium, Bradyrhizobium, Azorhizobium, Frankia, некоторые виды родов Chromatium, Klebsiella, некоторые циано-бактерии и др.).
Лекции по курсу «Физиология микроорганизмов». Лектор доцент Лысак В.В.

Железо как элемент питания
Микроорганизмам для осуществления жизнедеятельности требуется также в относительно больших количествах железо. Оно входит в состав гемов, FeS-центров и активных центров многих ферментов. Однако, несмотря на достаточно широкое распространение железа в земной коре (по степени распространения является четвертым элементом после кислорода, кремния и алюминия), оно не относится к числу легкодоступных веществ.
В аэробных условиях железо присутствует в среде в окисленной форме, Fe3+, образуя практически нерастворимые гидраты оксида железа FeО(ОН), карбонат железа Fe2(СО3)3 и магнетит Fe3О4. Эти соединения растворимы только при крайне низких значениях рН.
Лекции по курсу «Физиология микроорганизмов». Лектор доцент Лысак В.В.

Железо как элемент питания
Поэтому большинство аэробных микроорганизмов для поглощения железа синтезируют и секретируют в среду сидерофоры – органические соединения, образующие хелаты с Fe3+.
Далее в виде комплексов с сидерофорами железо поглощается микробными клетками. Поглощение железа микроорганизмами в аэробных условиях – сложный, строго регулируемый процесс, включающий несколько стадий: 1) синтез сидерофоров; 2) выделение сидерофоров из клетки; 3) транспорт хелатных комплексов Fe3+ с сидерофорами в клетку; 4) высвобождение Fe3+ из хелатного комплекса и восстановление до Fe2+ и 5) включение Fe2+ в состав коферментов и простетических групп.
Лекции по курсу «Физиология микроорганизмов». Лектор доцент Лысак В.В.

Транспорт веществ в клетку бактерий
Различают следующие способы поступления веществ в клетку бактерий: простая, или пассивная диффузия, облегченная диффузия, активный транпорт и транслокация группы.
Простая, или пассивная, диффузия – неспецифическое поступление веществ в клетку за счет разницы концентраций, т.е. происходит передвижение молекул из более концентрированного раствора в менее концентрированный – по градиенту концентрации.
Этот процесс не связан с затратой энергии.
Скорость перемещения веществ через мембрану путем простой диффузии невелика.
Лекции по курсу «Физиология микроорганизмов». Лектор доцент Лысак В.В.

Транспорт веществ в клетку бактерий
Таким путем осуществляется транcпорт газов, таких как О2, N2, CO2, H2 и NH3, а также низкомолекулярных веществ (например, воды и спиртов), ядов, ингибиторов, гидрофобных (растворимых в липидах) соединений, к которым относятся алифатические (напри-мер, бутанол) и ароматические соединения (например, бензол).
У грамотрицательных бактерий дополнительным барьером является наружная мембрана. . Она непроницаема для гидро-фильных веществ, таких как углеводы, аминокислоты, белки и др. Перенос этих молекул через наружную мембрану происхо-дит с помощью каналообразующих белков, которые представ-ляют собой наполненные водой поры и поэтому называются поринами.
Лекции по курсу «Физиология микроорганизмов». Лектор доцент Лысак В.В.

Облегченная диффузия (унипорт)
Перенос веществ при облегченной диффузии (унипорте) также происходит по градиенту концентрации переносимого вещества.
Этот процесс не требует затраты метаболической энергии и осуществляется с участием специальных преносчиков (транслоказ, или пермеаз).
Переносчики – вещества белковой природы, локализованные в мембране и характеризующиеся высокой субстратной специфич-ностью, – связываясь с субстратом они подвергаются конформаци-онным изменениям и вследствие этого приобретают способность к перемещению субстрата с одной стороны цитоплазматической мембраны на другую, где происходит его высвобождение.
Лекции по курсу «Физиология микроорганизмов». Лектор доцент Лысак В.В.

Облегченная диффузия (унипорт)
Путем облегченной диффузии происходит транспорт в клетку:
глюкозы у бактерий Zymomonas mobilis,
лизина у бактерий Bacillus stearothermophilus,
глицерола и ионов аммония у многих бактерий, и др.
Лекции по курсу «Физиология микроорганизмов». Лектор доцент Лысак В.В.

Активный транспорт
Активный транспорт – основной механизм избирательного переноса веществ через цитоплазматическую мембрану в клетку против градиента концентрации.
Этот процесс, так же как и облегченная диффузия, протекает при участии локализованных в цитоплазматической мембране транспортных белков пермеаз.
В отличие от облегченной диффузии для активного транпорта необходимы затраты энергии.
Источником энергии может быть ионный потенциал или молекулы АТФ.
Лекции по курсу «Физиология микроорганизмов». Лектор доцент Лысак В.В.

Активный транспорт
Различают активный транспорт первого и второго класса.
Наиболее распространенным механизмом активного поглощения субстратов является транспорт с использованием энергии электро-химического протонного потенциала (активный транспорт первого класса), который называют термином, предложенным П. Митчеллом, – протондвижущая сила (∆р). Энергия, запасенная в виде электрохимического протонного потенциала или потенциала других ионов, например Na+ (система первичного транспорта), используется в системах вторичного транспорта для осуществления движения растворенных веществ против градиента их концентрации.
Системы вторичного транcпорта действуют по механизму симпорта и антипорта.
Лекции по курсу «Физиология микроорганизмов». Лектор доцент Лысак В.В.

Активный транспорт
Примерами симпорта является перенос протона (Н+) и молекулы лактозы у бактерий E.coli, перенос пролина и иона Na+ у бактерий E.coli, поглощение глутамата у E.coli и двух ионов натрия и др.
В случае антипорта два вещества транспортируются в противоположных направлениях.
Принцип антипорта состоит в сопряжении двух потоков – движущего потока (происходит по градиенту концентрации субстрата) и движимого потока (происходит против градиента), таким образом, что один поток невозможен в отсутствие другого.
Лекции по курсу «Физиология микроорганизмов». Лектор доцент Лысак В.В.

Активный транспорт
Хорошо изучены механизмы антипорта субстрата и продукта реакции, например,
антипорт малат/лактат при сбраживании малата до лактата у Lactococcus lactis,
транспорт оксалат/формиат у Oxalobacter formigenes,
лактоза/галактоза и аргинин/орнитин у молочнокислых бактерий, а также механизмы антипорта относительно различающихся соединений, например,
фосфата и сахарофосфата у E.coli, или
токсичных соединений и продуктов их детоксикации (например, антипорт катион/тетрациклин).
Лекции по курсу «Физиология микроорганизмов». Лектор доцент Лысак В.В.

Активный транспорт
В системах активного транспорта второго класса перенос растворенного вещества сопряжен с синтезом или гидролизом АТФ.
К этому классу относятся АТФазы, или АТФ-синтазы. АТФазы участвуют в переносе небольших одновалентных (Н+, К+, Na+) или двухвалентных (Са2+, Mg2+) катионов, превращая энергию фосфатной связи АТФ в электрохимический градиент переносимого иона или наоборот – энергию градиента в энергию АТФ, как и в случае АТФ-синтаз, сопряженных с дыхательной цепью.
Лекции по курсу «Физиология микроорганизмов». Лектор доцент Лысак В.В.

Активный транспорт
Ко второму классу транспортных систем относится также транспорт веществ, зависимый от периплазматических субстратсвязывающих белков.
Этот транспорт связан с гидролизом АТФ и присутствует в основном у грамотрицательных бактерий.
Системы поглощения субстратов, зависящие от периплазматических субстрат-связывающих белков, характеризуются однонаправленностью транспорта.
Они обладают высоким сродством к субстрату и отличаются относительно низкой максимальной скоростью транспорта.
Лекции по курсу «Физиология микроорганизмов». Лектор доцент Лысак В.В.

Система поглощения мальтозы, зависящая от субстратсвязывающих белков у E.coli
Лекции по курсу «Физиология микроорганизмов». Лектор доцент Лысак В.В.

К третьему классу активного транспорта относятся специфические транспортные системы, которые осуществляют выделение из клеток ионов натрия, сопряженное с декарбоксилированием.
Эти системы открыты у бактерий Propionigenium modestum, Klebsiеlla pneumoniae и Salmonella typhimurium.
Декарбоксилированию подвергаются карбоновые кислоты, например оксалоацетат или метилмалонил-КоА.
Процесс катализирует мембраносвязанная, биотинзависимая декарбоксилаза.
Лекции по курсу «Физиология микроорганизмов». Лектор доцент Лысак В.В.

При транслокации группы происходит химическая модификация переносимых молекул, тогда как при пассивной диффузии, облегченной диффузии и активном транспорте они поступают в клетку в химически неизмененном виде.
На следующем рисунке представлены основные способы переноса веществ через мембрану в клетки бактерий.
Лекции по курсу «Физиология микроорганизмов». Лектор доцент Лысак В.В.

Лекции по курсу «Физиология микроорганизмов». Лектор доцент Лысак В.В.

Автотрофные способы питания микроорганизмов
Известно четыре различных механизма фиксации СО2. Наиболее распространен у прокариот цикл Кальвина, осуществляющийся также в хлоропластах растений. Он характерен для аэробных бактерий, хотя у аэробных архебактерий он, по-видимому, отсутствует.
Второй механизм фиксации СО2 – восстановительный цикл трикарбоновых кислот (цикл Арнона), который функционирует у зеленых серных бактерий рода Chlorobium, у некоторых сульфатредуцирующих бактерий рода Desulfobacter, у термофильных водородных бактерий рода Hydrogenobacter, окисляющих водород в микроаэробных условиях, и у анаэробных сульфатредуцирующих архебактерий рода Thermoproteus.
Лекции по курсу «Физиология микроорганизмов». Лектор доцент Лысак В.В.

Восстановительный
цикл
трикарбоновых
кислот
Лекции по курсу «Физиология микроорганизмов». Лектор доцент Лысак В.В.

Автотрофные способы питания микроорганизмов
На рисунке представлены реакции восстановительного цикла трикарбоновых кислот:
1 – малатдегидрогеназа;
2 - фумаратгидратаза (фумараза);
3 – фумаратредуктаза;
4 – сукцинил-КоА-синтаза;
5 – 2-оксоглутарат: ферредок-синоксидоредуктаза;
6 – изоцитратдегидрогеназа;
7 – аконитатгидратаза (аконитаза);
8 – АТФ-цитратлиаза.
Лекции по курсу «Физиология микроорганизмов». Лектор доцент Лысак В.В.

Третий механизм автотрофной фиксации СО2 – восстановительный ацетил-КоА путь осуществляется у некоторых сульфатредуцирующих бактерий (род Desulfobacterium) и архебактерий (род Archaeoglobus), а также у большинства ацетогенных и метаногенных бактерий, т.е. только у строгих анаэробов.
Четвертый путь – 3-гидроксипропионатный цикл – пока обнаружен только у фототрофной зеленой несерной бактерии Chloroflexus aurantiacus, по-видимому, он функционирует и у некоторых аэробных архебактерий. Этот циклический механизм, по которому происходит синтез глиоксилата из двух молекул бикарбоната, описывается следующим уравнением:
Лекции по курсу «Физиология микроорганизмов». Лектор доцент Лысак В.В.

Глиоксилат относится к метаболитам-предшественникам, используемым в биосинтетических реакциях.
На рисунке представлены реакции 3-гидроксипропионатного цикла.
1 – ацетил-КоА-карбоксилаза; 2 – дегидрогеназа малонового полуальдегида; 3 – 3-гидроксипропионатдегидрогеназа;
4 – 3-гидроксипропионат-КоА-лигаза; 5 – акрилоил-КоА-гидратаза;
6 – акрилоил-КоА-редуктаза; 7 – пропионил-КоА-карбоксилаза;
8 – метилмалонил-КоА-эпимераза; 9 – метилмалонил-КоА-мутаза;
10 – сукцинил-КоА:малат-КоА-трансфераза;
11 – сукцинатдегидрогеназа; 12 – фумаратгидратаза;
13 – малил-КоА-лиаза.
Лекции по курсу «Физиология микроорганизмов». Лектор доцент Лысак В.В.

3-гидроксипропио-
натный цикл
Лекции по курсу «Физиология микроорганизмов». Лектор доцент Лысак В.В.

Ассимиляция СО2 хемогетеротрофами
Все гетеротрофные микроорганизмы с помощью определенных ферментативных реакций активно включают диоксид углерода в метаболизм, при этом у прокариот пути использования его намного многообразнее, чем у эукариот.
Диоксид углерода у прокариот активно используется по путям как конструктивного, так и энергетического метаболизма. В конструктивном метаболизме он входит в состав веществ клетки. В энергетическом метаболизме ряда анаэробных эубактерий, получающих энергию в процессе брожения, а также некоторых эубактерий и архебактерий, осуществляющих анаэробное дыхание, СО2 служит для удаления избытка восстановителя, т.е. используется как конечный акцептор электронов.
Лекции по курсу «Физиология микроорганизмов». Лектор доцент Лысак В.В.

Ассимиляция СО2 хемогетеротрофами
В этом случае, СО2, участвующий в реакциях энергетического метаболизма, не включается в вещества клетки, а продукты его восстановления (в виде молекул метана, формиата, ацетата) накапливаются в среде.
Основным путем включения СО2 в вещества клетки у хемогетеротрофных прокариот служат реакции карбоксилирования (см. следующую таблицу).
Лекции по курсу «Физиология микроорганизмов». Лектор доцент Лысак В.В.

Реакции включения СО2 в метаболиты клеток
Лекции по курсу «Физиология микроорганизмов». Лектор доцент Лысак В.В.