А.Б. Рахманинова (13 апреля 2010 г.) Факультет Биоинженерии и Биоинформатики, 2 курс, весенний семестр Функции Мембранные белки. Транспо

Февраль 19, 2021

Главная
Разное
А.Б. Рахманинова (13 апреля 2010 г.) Факультет Биоинженерии и Биоинформатики, 2 курс, весенний семестр Функции Мембранные белки. Транспо

Содержание

2. АТФ-синтетаза Ацетилхолиновый рецептор
3. Объекты
4. Объекты β-баррель α-спирали
5. http://www.tcdb.org/index.php
6. V.W.X.Y.Z
7. В чем проблема? От 15% до 30% от общего числа белков — белки с хотя бы
8. В чем проблема?
10. von Heijne “the positive-inside rule”
11. http://opm.phar.umich.edu/
12. Как оценить качество паттерна или профиля? Или как оценить качество предсказания?
13. Ошибки…… Ошибки первого рода (FP): отвергается нулевая гипотеза, а она соответствует действительности. Ошибки второго рода (FN):
15. Скачать презентацию

Слайд 2

АТФ-синтетаза
Ацетилхолиновый
рецептор

АТФ-синтетаза Ацетилхолиновый рецептор

Слайд 3

Объекты

Объекты

Слайд 4

Объекты
β-баррель
α-спирали

Объекты β-баррель α-спирали

Слайд 5

http://www.tcdb.org/index.php

http://www.tcdb.org/index.php

Слайд 6

V.W.X.Y.Z

V.W.X.Y.Z

Слайд 7

В чем проблема?
От 15% до 30%
от общего числа белков
— белки
с

В чем проблема? От 15% до 30% от общего числа белков —

хотя бы одной
трансмембранной спиралью

Всего ≈59 705
белковых структур.
Мембранных - 217 (0.36% ),
2009

Слайд 8

В чем проблема?

В чем проблема?

Слайд 9

Слайд 10

von Heijne “the positive-inside rule”

von Heijne “the positive-inside rule”

Слайд 11

http://opm.phar.umich.edu/

http://opm.phar.umich.edu/

Слайд 12

Как оценить качество паттерна или профиля? Или как оценить качество предсказания?

Как оценить качество паттерна или профиля? Или как оценить качество предсказания?

Слайд 13

Ошибки……
Ошибки первого рода (FP): отвергается нулевая гипотеза, а она соответствует действительности.

Ошибки…… Ошибки первого рода (FP): отвергается нулевая гипотеза, а она соответствует действительности.

Ошибки второго рода (FN): принимается нулевая гипотеза, а она не верна.
Ошибки третьего рода: справедливо отвергнута нулевая гипотеза на основе неверных соображений.