Авиакомпания Сибирь

В 1995 году - директор Новосибирского филиала ИК "Еврофинансы".
В 1996-1998 годах - генеральный директор ИК "Еврофинансы-Новосибирск".
В 1997 году супруги Наталия и Владислав Филёвы выкупили у сотрудников акции авиакомпании «Сибирь». Сразу после кризиса 1998 года они стали владельцами контрольного пакета предприятия и занялись развитием бизнеса за счет поглощения мелких авиаперевозчиков.

Карьера Натальи неотделима от деятельности ее мужа. Супруги Филевы пришли в авиационный бизнес в конце 90-х достаточно случайно. По неофициальной версии, чиновники администрации Новосибирской области попросили инвесткомпанию супругов объединить свободные акции авиакомпании "Сибирь", находившейся в предбанкротном состоянии. Собранный ими пакет был объединен с акциями, которыми управляла администрация.
В мае 2004 контрольный пакет "Сибири" был зарегистрирован на Наталью. Благодаря именно этому решению, в 2006 она вошла в рейтинг самых успешных женщин России по версии журнала "Финанс" с оценкой капитала в $155 млн.
Наталья стала главным стратегом компании, отдавая публичную часть деятельности и контакты с журналистами супругу. Считается, что именно она создала новый имидж компании: была инициатором ребрендинга и смены международного названия авиаперевозчика на S7 Airlines.

В сентябре 2016 года S7 Group приобрела плавучий космодром «Морской старт». Сделка предусматривает покупку корабля Sea Launch Commander и платформы Odyssey с установленным на них оборудованием ракетного сегмента, а также наземного оборудования в базовом порту Лонг-Бич (США) и товарного знака «Sea Launch».