Evidence of non-random mutation rates

Управление рисками, риск-менеджмент (англ. risk management) — процесс принятия и выполнения управленческих решений, направленных на снижение вероятности возникновения неблагоприятного результата и минимизацию возможных потерь, вызванных его реализацией.

>120.000 SNP
34 штамма E.coli
3.420 генов-ортологов (BLAST-hit)
1. Multiple alignment
2. Multiple phylogenetic filters
2.930 генов
3. θs values
θs – within-species synonymous diversity

θs – within-species synonymous diversity
θs – within-species synonymous diversity

На θs могут влиять:
Частота мутаций
Отсекающий (отрицательный) отбор – предпочтительное использование кодонов

CUB – codon usage bias (предпочтительное использование кодонов)
γ – коэффициент отбора
CUB – codon usage bias (предпочтительное использование кодонов)
γ – коэффициент отбора

На θs могут влиять:
Частота мутаций
Отсекающий (отрицательный) отбор – предпочтительное использование кодонов
Стабильность фолдинга мРНК на 5’-концах генов