МАСС-СПЕКТРОМЕТРИЯ В ПРОТЕОМНЫХ ИССЛЕДОВАНИЯХ
Белки и пептиды Моноизотопные массы аминокислотных остатков ADLKQLMDNEVLMAFTSYATIILAKMMFLSSATAFQRLTNKVFANPEDCAGFGKGENAKKFLRTDEKVERVRRAHLNDLENIVPFLGIGLLYSLSGPDLSTALIHFRIFVGARIYHTIAYLTPLPQPNRGLAFFVGYGVTLSMAYRLLRSRLYL (Глутатион-трансфераза человека) пептидная связь аминокислотный остаток SAPASTTQPIGSTTSTTTKTAGATPATASGLFTIPDGDFFSTARAIVASNAVATNEDLSKIEAIWKDMKVPTDTMAQAAWDLVRHCADVGSSAQTEMIDTGPYSNGISRARLAAAIKEVCTLRQFCMKYAPVVWNWMLTNNSPPANWQAQGFKPEHKFAAFDFFNGVTNPAAIMPKEGLIRPPSEAEMNAAQTAAFVKITKARAQSNDFASLDAAVTRGRITGTTTAEAVVTLPPP (Белок оболочки Х-вируса картофеля) Пептидный фингерпринт Num From-To MH+ HPLC pI Sequence 1 1- 19 1836.92 14,27 9,85 SAPASTTQPIGSTTSTTTK 1 1- 19 1878.93 14,27 9,85 SAPASTTQPIGSTTSTTTK 2 20- 44 2472.20 24,79 3,92 TAGATPA..PDGDFFSTAR 3 45- 60 1602.83 12,87 4,11 AIVASNAVATNEDLSK 4 61- 66 759.44 19,33 6,99 IEAIWK 5 67- 69 393.18 4,27 6,99 DMK 6 70- 84 1673.83 19,51 3,92 VPTDTMAQAAWDLVR 7 85-109 2595.13 22,48 4,34 HCADVGSS..GPYSNGISR 8 110-111 246.16 1,78 11,20 AR 9 112-117 586.39 12,82 10,10 LAAAIK 10 118-123 719.36 14,84 6,29 EVCTLR 11 124-128 655.28 17,08 8,68 QFCMK 12 129-157 3410.65 28,07 9,42 YAPVVWNWM..QGFKPEHK 13 158-176 2058.02 24,21 6,97 FAAFDFFNGVTNPAAIMPK 14 177-198 2330.18 20,92 4,60 EGLIRPPS..AAQTAAFVK 15 199-201 361.25 6,80 10,15 ITK 16 202-203 246.16 1,78 11,20 AR 17 204-218 1565.76 14,77 3,92 AQSNDFASLDAAVTR 18 219-220 232.14 2,11 11,15 GR 19 221-236 1567.86 17,90 3,15 ITGTTTAEAVVTLPPP Num From-To MH+ HPLC pI Sequence 1 1- 56 5430.68 29,08 4,35 SAPASTTQPI…IVASNAVATNE 1 1- 56 5472.69 29,08 4,35 SAPASTTQPI…IVASNAVATNE 2 57- 62 704.38 12,90 4,11 DLSKIE 3 63- 96 3730.75 28,42 4,58 AIWKDMKVPT..ADVGSSAQTE 4 97-118 2334.22 22,73 9,58 MIDTGPYSNGISRARLAAAIKE 5 119-155 4353.07 35,01 9,02 VCTLRQFCMKY…NWQAQGFKPE 6 156-177 2452.21 24,30 7,58 HKFAAFDFFNGVTNPAAIMPKE 7 178-185 868.49 16,16 7,04 GLIRPPSE 8 186-187 219.10 1,83 3,25 AE 9 188-228 4255.19 24,38 10,52 MNAAQTAAFV…RGRITGTTTAE 10 229-236 793.48 14,07 6,96 AVVTLPPP Трипсин ( /R,K) Стафилококковая протеаза V8 ( /E) Пептидный калькулятор GPMAW 4.04