Домашнее задание №2: подбор условий для обнаружения SNP методом RFLP

Слайд 2

2. Скопировать последовательность около полиморфизма SNP±250 нуклеотидов (в примере SNP обозначен как

2. Скопировать последовательность около полиморфизма SNP±250 нуклеотидов (в примере SNP обозначен как
Y, т.е. вариация пиримидинов C/T) в текстовый файл.

Слайд 3

3. На сайте проекта RestrictionMapper вставить в окно формы последовательность SNP±250 нуклеотидов

3. На сайте проекта RestrictionMapper вставить в окно формы последовательность SNP±250 нуклеотидов
и нажать Map Sites для поиска сайтов рестрикции (на месте SNP указать какой-то его вариант)

Слайд 4

4. В появившемся отчёте выбрать рестриктазы с единичным сайтом разрезания (Cut Position)

4. В появившемся отчёте выбрать рестриктазы с единичным сайтом разрезания (Cut Position)
недалеко от позиции SNP (251). Выполнить пп.3-4 с альтернативным вариантом SNP и выбрать рестриктазу, у которой сайт узнавания есть только для одного из вариантов.

Слайд 5

5. Записать в файл название рестриктазы и место разрезания для неё (информация

5. Записать в файл название рестриктазы и место разрезания для неё (информация
доступна, если нажать на название рестриктазы на предыдущем этапе).