Анча Баранова, д.б.н. Associate Professor George Mason University, Fairfax, VA, USA Гл. Науч.Сотрудник МГНЦ РАМН, Москва, Россия

Цель исследования:
разработка метрики, позволяющий проводить комплексную оценку биологических образцов по тысячам параметоров, измеряемых одновременно
Normal
Tumor

Определение степени схожести образца со стандартом производится по принципу распознавания образа
Кто это ? -- немедленный ответ (это Дарвин)
A вот биомаркеры
с быстрым ответом
не справятся:
X: расстояние от кончика носа
до верхней губы
Y: диамерт уха
Z: количество волос в бороде

Центр пространства
занимаемого образцами
Карциномы простаты
DCancer
Центр пространства
занимаемого образцами
нормальной простаты
DNormal

Распознавание опухолей с помощью полных профилей работает ничуть не хуже, чем анализ биомаркеров
Сходная картина

Образцы предраковых состояний ровно посредине между опухолью и нормой
Нормальный пищевод
Пищевод Баррета (предраковое сост)
Карцинома пищевода

Пример практического применения – наглядный ответ на вопрос больного: «насколько плоха моя опухоль?»
Опухоль данного боьного

Универсальность метода
В качестве измеряемых величин могут быть использованы практически любые параметры,
- индивидуальные уровни экспрессии каждого гена в составе полных профилей экспрессии
- уровни экспрессии белков
- любые другие физические измерения биологических объектов.

Данный метод не зависит от конкретной инструментальной платформы.
NextGen Seq – или микрочипы – все равно

Технология будущего
Референсная
лаборатория
Профили примерно сотни
нормальных образцов простаты
Определние пространства нормальных образцов,
специфичное для данного оборудования
Измерение дистанции от каждого опухолевого образца
до центра глрмального пространства