Автоматизация разработки параллельных программ для современных высокопроизводительных ЭВМВ.А. КрюковФакультет ВМК МГУ,Инсти

Содержание

Слайд 2

План изложения

Модели и языки программирования с явным параллелизмом (абстрактная и целевая

План изложения Модели и языки программирования с явным параллелизмом (абстрактная и целевая
машина, уровень, компилятор/библиотека, новый язык/расширение существующего, новые конструкции/директивы компилятору)
Языки программирования с неявным параллелизмом + автоматическое распараллеливание (Fortran, C, C++)
Автоматизация преобразования имеющихся последовательных программ в эффективные параллельные программы на языках с явным или неявным параллелизмом
Автоматизация отладки

Слайд 3

Модели и языки программирования с явным параллелизмом

абстрактная параллельная машина и целевая ЭВМ:

Модели и языки программирования с явным параллелизмом абстрактная параллельная машина и целевая
многоядерный кластер с ускорителями/ многоядерный кластер/ одноядерный кластер/ узел кластера/ много ускорителей/ один ускоритель
высокий или низкий уровень, глобальный или фрагментарный взгляд
компилятор или библиотека
новый язык или расширение существующего
новые конструкции или директивы компилятору

Слайд 4

Модели и языки с явным параллелизмом

Модели и языки с явным параллелизмом

Слайд 5

Алгоритм Якоби на языке Fortran

PROGRAM JACOB_SEQ
PARAMETER (L=8, ITMAX=20)
REAL

Алгоритм Якоби на языке Fortran PROGRAM JACOB_SEQ PARAMETER (L=8, ITMAX=20) REAL A(L,L),
A(L,L), B(L,L)
PRINT *, '********** TEST_JACOBI **********'
DO IT = 1, ITMAX
DO J = 2, L-1
DO I = 2, L-1
A(I, J) = B(I, J)
ENDDO
ENDDO
DO J = 2, L-1
DO I = 2, L-1
B(I, J) = (A(I-1, J) + A(I, J-1) + A(I+1, J) +
* A(I, J+1)) / 4
ENDDO
ENDDO
ENDDO
END

Слайд 6

Distribution of array A [8][8]

Distribution of array A [8][8]

Слайд 7

PROGRAM JACOB_MPI
include 'mpif.h'
integer me, nprocs
PARAMETER (L=4096, ITMAX=100, LC=2,

PROGRAM JACOB_MPI include 'mpif.h' integer me, nprocs PARAMETER (L=4096, ITMAX=100, LC=2, LR=2)
LR=2)
REAL A(0:L/LR+1,0:L/LC+1), B(L/LR,L/LC)
C arrays A and B with block distribution
integer dim(2), coords(2)
logical isper(2)
integer status(MPI_STATUS_SIZE,4), req(8), newcomm
integer srow,lrow,nrow,scol,lcol,ncol
integer pup,pdown,pleft,pright
dim(1) = LR
dim(2) = LC
isper(1) = .false.
isper(2) = .false.
reor = .true.
call MPI_Init( ierr )
call MPI_Comm_rank( mpi_comm_world, me, ierr )
call MPI_Comm_size( mpi_comm_world, nprocs, ierr)
call MPI_Cart_create(mpi_comm_world,2,dim,isper,
* .true., newcomm, ierr)
call MPI_Cart_shift(newcomm,0,1,pup,pdown, ierr)
call MPI_Cart_shift(newcomm,1,1,pleft,pright, ierr)
call MPI_Comm_rank (newcomm, me, ierr)
call MPI_Cart_coords(newcomm,me,2,coords, ierr)

Слайд 8

C rows of matrix I have to process
srow = (coords(1) *

C rows of matrix I have to process srow = (coords(1) *
L) / dim(1)
lrow = (((coords(1) + 1) * L) / dim(1))-1
nrow = lrow - srow + 1
C colomns of matrix I have to process
scol = (coords(2) * L) / dim(2)
lcol = (((coords(2) + 1) * L) / dim(2))-1
ncol = lcol - scol + 1
call MPI_Type_vector(ncol,1,nrow+2,MPI_DOUBLE_PRECISION,
* vectype, ierr)
call MPI_Type_commit(vectype, ierr)
IF (me .eq. 0) PRINT *, '***** TEST_JACOBI *******'
DO IT = 1, ITMAX
DO J = 1, ncol
DO I = 1, nrow
A(I, J) = B(I, J)
ENDDO
ENDDO
C Copying shadow elements of array A from
C neighbouring processors before loop execution

Слайд 9

call MPI_Irecv(A(1,0),nrow,MPI_DOUBLE_PRECISION,
* pleft, 1235, MPI_COMM_WORLD, req(1), ierr)
call MPI_Isend(A(1,ncol),nrow,MPI_DOUBLE_PRECISION,
*

call MPI_Irecv(A(1,0),nrow,MPI_DOUBLE_PRECISION, * pleft, 1235, MPI_COMM_WORLD, req(1), ierr) call MPI_Isend(A(1,ncol),nrow,MPI_DOUBLE_PRECISION, * pright,
pright, 1235, MPI_COMM_WORLD,req(2), ierr)
call MPI_Irecv(A(1,ncol+1),nrow,MPI_DOUBLE_PRECISION,
* pright, 1236, MPI_COMM_WORLD, req(3), ierr)
call MPI_Isend(A(1,1),nrow,MPI_DOUBLE_PRECISION,
* pleft, 1236, MPI_COMM_WORLD,req(4), ierr)
call MPI_Irecv(A(0,1),1,vectype,
* pup, 1237, MPI_COMM_WORLD, req(5), ierr)
call MPI_Isend(A(nrow,1),1,vectype,
* pdown, 1237, MPI_COMM_WORLD,req(6), ierr)
call MPI_Irecv(A(nrow+1,1),1,vectype,
* pdown, 1238, MPI_COMM_WORLD, req(7), ierr)
call MPI_Isend(A(1,1),1,vectype,
* pup, 1238, MPI_COMM_WORLD,req(8), ierr)
call MPI_Waitall(8,req,status, ierr)
DO J = 2, ncol-1
DO I = 2, nrow-1
B(I, J) = (A( I-1, J ) + A( I, J-1 ) +
* A( I+1, J) + A( I, J+1 )) / 4
ENDDO
ENDDO
ENDDO
call MPI_Finalize(ierr)
END

Слайд 10

PROGRAM JACOB_OpenMP
PARAMETER (L=4096, ITMAX=100)
REAL A(L,L), B(L,L)
PRINT *, '**********

PROGRAM JACOB_OpenMP PARAMETER (L=4096, ITMAX=100) REAL A(L,L), B(L,L) PRINT *, '********** TEST_JACOBI
TEST_JACOBI **********'
!$OMP PARALLEL
DO IT = 1, ITMAX
!$OMP DO
DO J = 2, L-1
DO I = 2, L-1
A(I,J) = B(I,J)
ENDDO
ENDDO
!$OMP DO
DO J = 2, L-1
DO I = 2, L-1
B(I,J) = (A(I-1,J) + A(I,J-1) +
* A(I+1,J) + A(I,J+1)) / 4
ENDDO
ENDDO
ENDDO
!$OMP END PARALLEL
END

Слайд 11

module jac_cuda
contains
attributes(global) subroutine arr_copy(a, b, k)
real, device, dimension(k, k) :: a,

module jac_cuda contains attributes(global) subroutine arr_copy(a, b, k) real, device, dimension(k, k)
b
integer, value :: k
integer i, j
i = (blockIdx%x - 1) * blockDim%x + threadIdx%x
j = (blockIdx%y - 1) * blockDim%y + threadIdx%y
if (i.ne.1 .and. i.ne.k .and. j.ne.1 .and. j.ne.k) then a(i, j) = b(i, j)
endif
end subroutine arr_copy
attributes(global) subroutine arr_renew(a, b, k)
real, device, dimension(k, k) :: a, b
integer, value :: k
integer i, j
i = (blockIdx%x - 1) * blockDim%x + threadIdx%x
j = (blockIdx%y - 1) * blockDim%y + threadIdx%y
if (i.ne.1 .and. i.ne.k .and. j.ne.1 .and. j.ne.k) then b(i,j) = (a(i-1,j) + a(i+1,j) + a(i,j-1) + a(i, j+1))/4
endif
end subroutine arr_renew
end module jac_cuda

Слайд 12

program JACOB_CUDA
use cudafor
use jac_cuda
parameter (k=4096, itmax = 100, block_dim = 16)
real,

program JACOB_CUDA use cudafor use jac_cuda parameter (k=4096, itmax = 100, block_dim
device, dimension(k, k) :: a, b
integer it
type(dim3) :: grid, block
print *, '********** test_jacobi **********‘
grid = dim3(k / block_dim, k / block_dim, 1)
block = dim3(block_dim, block_dim, 1)
do it = 1, itmax
call arr_copy<<>>(a, b, k)
call arr_renew<<>>(a, b, k)
end do
end program jacob_CUDA

Слайд 13

PROGRAM JACOB_PGI_APM
PARAMETER (L=4096, ITMAX=100)
REAL A(L,L), B(L,L)
PRINT *, '**********

PROGRAM JACOB_PGI_APM PARAMETER (L=4096, ITMAX=100) REAL A(L,L), B(L,L) PRINT *, '********** TEST_JACOBI
TEST_JACOBI **********‘
!$acc data region copyout(B), local(A)
DO IT = 1, ITMAX
!$acc region
DO J = 2, L-1
DO I = 2, L-1
A(I,J) = B(I,J)
ENDDO
ENDDO
DO J = 2, L-1
DO I = 2, L-1
B(I,J) = (A(I-1,J ) + A(I,J-1 ) +
* A(I+1,J ) + A(I,J+1 )) / 4
ENDDO
ENDDO
!$acc end region
ENDDO
!$acc end data region
END

Слайд 14

Автоматическое распараллеливание

Для распределенных систем проблематично в силу следующих причин:
вычислительная работа должна

Автоматическое распараллеливание Для распределенных систем проблематично в силу следующих причин: вычислительная работа
распределяться между процессорами крупными порциями
на системах с распределенной памятью необходимо произвести не только распределение вычислений, но и распределение данных, а также обеспечить на каждом процессоре доступ к удаленным данным - данным, расположенным на других процессорах
распределение вычислений и данных должно быть произведено согласованно

Слайд 15

Модель параллелизма по данным

отсутствует понятие процесса и, как следствие, явная передача

Модель параллелизма по данным отсутствует понятие процесса и, как следствие, явная передача
сообщений или явная синхронизация
данные последовательной программы распределяются программистом по процессорам параллельной машины
последовательная программа преобразуется компилятором в параллельную программу
вычисления распределяются по правилу собственных вычислений: каждый процессор выполняет только вычисления собственных данных

Слайд 16

HPF (High Performance Fortran)

HPF (1993 год) - расширение языка Фортран 90
HPF-2 (1997

HPF (High Performance Fortran) HPF (1993 год) - расширение языка Фортран 90
год) - расширение языка Фортран 95
Распределение данных производится в два этапа
с помощью директивы ALIGN задается соответствие между взаимным расположением элементов нескольких массивов
группа массивов с помощью директивы DISTRIBUTE отображается на решетку процессоров
Заданное распределение данных может быть изменено на этапе выполнения программы с помощью операторов REALIGN и REDISTRIBUTE

Слайд 17

PROGRAM JAC_HPF
PARAMETER (L=8, ITMAX=20)
REAL A(L,L), B(L,L)
!HPF$ PROCESSORS P(3,3)
!HPF$ DISTRIBUTE

PROGRAM JAC_HPF PARAMETER (L=8, ITMAX=20) REAL A(L,L), B(L,L) !HPF$ PROCESSORS P(3,3) !HPF$
( BLOCK, BLOCK) :: A
!HPF$ ALIGN B(I,J) WITH A(I,J)
C arrays A and B with block distribution
PRINT *, '********** TEST_JACOBI **********'
DO IT = 1, ITMAX
!HPF$ INDEPENDENT
DO J = 2, L-1
!HPF$ INDEPENDENT
DO I = 2, L-1
A(I, J) = B(I, J)
ENDDO
ENDDO
!HPF$ INDEPENDENT
DO J = 2, L-1
!HPF$ INDEPENDENT
DO I = 2, L-1
B(I, J) = (A(I-1, J) + A(I, J-1) +
* A(I+1, J) + A(I, J+1)) / 4
ENDDO
ENDDO
ENDDO
END

Слайд 18

PROGRAM JACOB_DVM
PARAMETER (L=4096, ITMAX=100)
REAL A(L,L), B(L,L)
CDVM$ DISTRIBUTE ( BLOCK,

PROGRAM JACOB_DVM PARAMETER (L=4096, ITMAX=100) REAL A(L,L), B(L,L) CDVM$ DISTRIBUTE ( BLOCK,
BLOCK) :: A
CDVM$ ALIGN B(I,J) WITH A(I,J)
C arrays A and B with block distribution
PRINT *, '********** TEST_JACOBI **********'
DO IT = 1, ITMAX
CDVM$ PARALLEL (J,I) ON A(I,J)
DO J = 2, L-1
DO I = 2, L-1
A(I,J) = B(I,J)
ENDDO
ENDDO
CDVM$ PARALLEL (J,I) ON B(I,J),SHADOW_RENEW (A)
C Copying shadow elements of array A from
C neighboring processors before loop execution
DO J = 2, L-1
DO I = 2, L-1
B(I,J) = (A(I-1,J) + A(I,J-1) +
* A(I+1,J) + A(I,J+1)) / 4
ENDDO
ENDDO
ENDDO
END

Слайд 19

Новые языки параллельного программирования (PGAS)

PGAS – Partitioned Global Address Space (не DSM

Новые языки параллельного программирования (PGAS) PGAS – Partitioned Global Address Space (не
!)
CAF (Co-Array Fortran), UPC (Unified Parallel C), Titanium (расширение Java)
2005 г.:
Много нитей выполняют одну программу в стиле SPMD
Уровень языков не намного выше MPI
Нет аналога коммуникаторов
Нет средств совмещения обменов с вычислениями

Слайд 20

Coarray Fortran
PROGRAM Jac_CoArray
PARAMETER (L=8, ITMAX=20, LR=2, LC=2)
PARAMETER (NROW=L/LR,

Coarray Fortran PROGRAM Jac_CoArray PARAMETER (L=8, ITMAX=20, LR=2, LC=2) PARAMETER (NROW=L/LR, NCOL=L/LC)
NCOL=L/LC)
INTEGER ME, I, J, IT
INTEGER ME_R, ME_C, ME_UP, ME_LEFT, ME_RIGHT, ME_DOWN
REAL A (0: NROW +1,0:NCOL+1)[0:LR-1,0:*]
REAL B (1:NROW,1:NCOL)[0:LR-1,0:*]
ME = THIS_IMAGE()
ME_R = (ME-1)/LR
ME_C = (ME-1) - ME_R*LR
ME_UP = MOD(ME_R-1+LR,LR)
ME_DOWN = MOD(ME_R+1+LR,LR)
ME_RIGHT = MOD(ME_C+1+LC,LC)
ME_LEFT = MOD(ME_C-1+LC,LC)

Слайд 21

DO IT = 1, ITMAX
CALL SYNC_ALL ( )
DO J =

DO IT = 1, ITMAX CALL SYNC_ALL ( ) DO J =
1, NCOL
DO I = 1, NROW
A(I, J) = B(I, J)
ENDDO
ENDDO
C Copying shadow elements of array A from
C neighbouring images before loop execution
A(1:NROW,NCOL+1) = A(1:NROW,1)[ME_R, ME_RIGHT]
A(1:NROW,0) = A(1:NROW,NCOL)[ME_R, ME_LEFT]
A(NROW+1,1:NCOL) = A(1,1:NCOL)[ME_DOWN,ME_C ]
A(0,1:NCOL) = A(NROW,1:NCOL)[ME_UP,ME_C ]
DO J = 1, NCOL
DO I = 1, NROW
B(I, J) = (A( I-1, J ) + A( I, J-1 ) +
* A( I+1, J) + A( I, J+1 )) / 4
ENDDO
ENDDO
ENDDO
CALL SYNC_ALL ( )
END

Слайд 22

Развитие языков (PGAS=>APGAS)

Добавление асинхронности в CAF и UPC
CAF 2.0:
подгруппы процессов,
топологии,

Развитие языков (PGAS=>APGAS) Добавление асинхронности в CAF и UPC CAF 2.0: подгруппы

новые средства синхронизации процессов,
коллективные коммуникации,
средства совмещения обменов с вычислениями,
динамическое создание асинхронных активностей
(этого нет в Фортране 2008)

Слайд 23

SEQ – последовательная программа, MPI –параллельная MPI-программа
DVM – параллельная DVM-программа, CAF –

SEQ – последовательная программа, MPI –параллельная MPI-программа DVM – параллельная DVM-программа, CAF
параллельная CoArray Fortran программа

Слайд 24

Создаваемые языки параллельного программирования (HPCS)

DARPA – High Productivity Computing Systems
2002-2010
(эффективность,

Создаваемые языки параллельного программирования (HPCS) DARPA – High Productivity Computing Systems 2002-2010
программируемость, переносимость ПО, надежность)
Chapel (Cray), APGAS
X10 (IBM), APGAS
ООП

Слайд 25

Цели разработки Chapel (Cray)

Снизить трудоемкость программирования - написание программы, ее изменение, тюнинг, портирование,

Цели разработки Chapel (Cray) Снизить трудоемкость программирования - написание программы, ее изменение,
сопровождение
Эффективность программ на уровне MPI - сравнимо на обычных кластерах - выше на более продвинутых архитектурах
Эффективность при портировании - как MPI, но лучше OpenMP, CAF, UPC
Надежность - исключить часто встречающиеся ошибки - повысить уровень абстракции чтобы снизить вероятность других ошибок

Слайд 26

Основные черты языка Chapel

Полнота поддержки параллелизма - параллелизм по данным, параллелизм задач,

Основные черты языка Chapel Полнота поддержки параллелизма - параллелизм по данным, параллелизм
вложенный параллелизм - отражение всех уровней параллелизма программы - использование всех уровней параллелизма ЭВМ
Поддержка глобального (а не фрагментарного!) взгляда на программу (управление и данные)
Управление локализацией данных и вычислений, задаваемые программистом методы распределения
Включение широко используемых возможностей последовательных языков (ООП)
Новый синтаксис (чтобы не путать с привычным!) и семантика конструкций языка

Слайд 27

Основные отличия X10 (IBM)

Является расширением языка Java
Отличие доступа к локальным и удаленным

Основные отличия X10 (IBM) Является расширением языка Java Отличие доступа к локальным
данным (как в языках PGAS)
Свои методы синхронизации
Ориентация на параллельные системы с распределенной памятью
Open source проект

Слайд 28

PROGRAM JACOB_DVM_OpenMP
PARAMETER (L=4096, ITMAX=100)
REAL A(L,L), B(L,L)
CDVM$ DISTRIBUTE ( BLOCK,

PROGRAM JACOB_DVM_OpenMP PARAMETER (L=4096, ITMAX=100) REAL A(L,L), B(L,L) CDVM$ DISTRIBUTE ( BLOCK,
BLOCK) :: A
CDVM$ ALIGN B(I,J) WITH A(I,J)
PRINT *, '********** TEST_JACOBI **********'
C$OMP PARALLEL
DO IT = 1, ITMAX
CDVM$ PARALLEL (J,I) ON A(I, J)
C$OMP DO
DO J = 2, L-1
DO I = 2, L-1
A(I, J) = B(I, J)
ENDDO
ENDDO
CDVM$ PARALLEL (J,I) ON B(I, J), SHADOW_RENEW (A)
C$OMP DO
DO J = 2, L-1
DO I = 2, L-1
B(I, J) = (A(I-1, J) + A(I, J-1) + A(I+1, J) +
* A(I, J+1)) / 4
ENDDO
ENDDO
ENDDO
C$OMP END PARALLEL
END

Слайд 29

PROGRAM JACOB_DVMH
PARAMETER (L=4096, ITMAX=100)
REAL A(L,L), B(L,L)
CDVM$ DISTRIBUTE ( BLOCK,

PROGRAM JACOB_DVMH PARAMETER (L=4096, ITMAX=100) REAL A(L,L), B(L,L) CDVM$ DISTRIBUTE ( BLOCK,
BLOCK) :: A
CDVM$ ALIGN B(I,J) WITH A(I,J)
PRINT *, '********** TEST_JACOBI **********'
DO IT = 1, ITMAX
CDVM$ REGION
CDVM$ PARALLEL (J,I) ON A(I, J)
DO J = 2, L-1
DO I = 2, L-1
A(I, J) = B(I, J)
ENDDO
ENDDO
CDVM$ PARALLEL (J,I) ON B(I, J), SHADOW_RENEW (A)
DO J = 2, L-1
DO I = 2, L-1
B(I, J) = (A(I-1, J) + A(I, J-1) + A(I+1, J) +
* A(I, J+1)) / 4
ENDDO
ENDDO
CDVM$ END REGION
ENDDO
END

Слайд 30

Времена выполнения программы JACRED_DVMH (сек) на кластере K-100

Времена выполнения программы JACRED_DVMH (сек) на кластере K-100

Слайд 31

План изложения

Модели и языки программирования с явным параллелизмом (абстрактная и целевая машина,

План изложения Модели и языки программирования с явным параллелизмом (абстрактная и целевая
уровень, компилятор/библиотека, новый язык/расширение существующего, новые конструкции/директивы компилятору)
Языки программирования с неявным параллелизмом + автоматическое распараллеливание (Fortran, C, C++)
Автоматизация преобразования имеющихся последовательных программ в эффективные параллельные программы на языках с явным или неявным параллелизмом
Автоматизация отладки

Слайд 32

Автоматизация параллельного программирования

Два новых (2005 г.) направления автоматизации в системе DVM:
дисциплина

Автоматизация параллельного программирования Два новых (2005 г.) направления автоматизации в системе DVM:
написания на языках последовательного программирования “потенциально параллельных программ” - таких программ, которые могут быть автоматически (без участия пользователя) преобразованы в эффективные параллельные программы
автоматизированное (с участием пользователя) преобразование последовательных программ в потенциально параллельные программы

Слайд 33

Автоматизация разработки параллельных программ для кластеров

Программа на
последовательном
языке S

Задание на отладку

Распараллеливающий
компилятор
с

Автоматизация разработки параллельных программ для кластеров Программа на последовательном языке S Задание
языка S

Характеристики
эффективности

Средства
функциональной
отладки

Средства отладки
эффективности

Протокол отладки

Результаты компиляции

Кластер

Инструментальная
ЭВМ

Слайд 34


Формирование вариантов распределения данных (ВРД)

Анализ последовательной программы

Для каждого ВРД формирование схем

Формирование вариантов распределения данных (ВРД) Анализ последовательной программы Для каждого ВРД формирование

распараллеливания - добавление вариантов
распределения вычислений и доступа к данным

Оценка эффективности каждой схемы на множестве
возможных решеток процессоров заданной ЭВМ
и выбор наилучшей схемы

Генерация параллельной программы
по лучшей схеме

Алгоритм работы распараллеливающего компилятора АРК-DVM

Слайд 35

Анализ последовательной программы

Статический анализ – указатели, косвенная индексация, параметры….
Динамический анализ – ресурсы

Анализ последовательной программы Статический анализ – указатели, косвенная индексация, параметры…. Динамический анализ
времени и памяти, представительность входных данных
?
Дополнительные спецификации программиста (декларативные, без ориентации на модель параллелизма), например, независимость витков, размеры массивов,….

Слайд 36

Алгоритм Якоби на языке Fortran

PROGRAM JACOB_SEQ
PARAMETER (L=8, ITMAX=20)
REAL

Алгоритм Якоби на языке Fortran PROGRAM JACOB_SEQ PARAMETER (L=8, ITMAX=20) REAL A(L,L),
A(L,L), B(L,L)
PRINT *, '********** TEST_JACOBI **********'
DO IT = 1, ITMAX
DO J = 2, L-1
DO I = 2, L-1
A(I, J) = B(I, J)
ENDDO
ENDDO
DO J = 2, L-1
DO I = 2, L-1
B(I, J) = (A(I-1, J) + A(I, J-1) + A(I+1, J) +
* A(I, J+1)) / 4
ENDDO
ENDDO
ENDDO
END

Слайд 37

Поиск наилучшей схемы распараллеливания

Логическая сложность алгоритмов построения и оценки схем распараллеливания (мало

Поиск наилучшей схемы распараллеливания Логическая сложность алгоритмов построения и оценки схем распараллеливания
зависит от выходного языка параллельного программирования P)
Огромное число возможных схем => необходимы эвристики

Слайд 38

Блоки компилятора АРК-DVM

Анализатор 1

Описание ЭВМ

Фортран программа

База данных

Эксперт 1

Фортран-DVM программа

Анализатор 2

Эксперт

Блоки компилятора АРК-DVM Анализатор 1 Описание ЭВМ Фортран программа База данных Эксперт
2

Фортран-DVM/OpenMP программа

Слайд 39

Работа компилятора проверена на:
тестах NAS LU, BT, SP (3D Навье-Стокс) - класс

Работа компилятора проверена на: тестах NAS LU, BT, SP (3D Навье-Стокс) -
С и А
программе MHPDV (трехмерного моделирования сферического взрыва во внешнем магнитном поле с помощью решения уравнений идеальной магнитогидродинамики)
программе ZEBRA (расчет нейтронных полей атомного реактора в диффузионном приближении)

Апробация компилятора АРК-DVM

Слайд 40

Характеристики программ

Характеристики программ

Слайд 41

Времена выполнения (сек) на МВС-100К DVM-программ класса С

Времена выполнения (сек) на МВС-100К DVM-программ класса С

Слайд 42

План изложения

Модели и языки программирования с явным параллелизмом (абстрактная и целевая машина,

План изложения Модели и языки программирования с явным параллелизмом (абстрактная и целевая
уровень, компилятор/библиотека, новый язык/расширение существующего, новые конструкции/директивы компилятору)
Языки программирования с неявным параллелизмом + автоматическое распараллеливание (Fortran, C, C++)
Автоматизация преобразования имеющихся последовательных программ в эффективные параллельные программы на языках с явным или неявным параллелизмом
Автоматизация отладки

Слайд 43

Автоматизированное распараллеливание последовательных программ

Диалог с пользователем для:
Исследования результатов анализа и задания характеристик

Автоматизированное распараллеливание последовательных программ Диалог с пользователем для: Исследования результатов анализа и
программы, недоступных для анализа, но необходимых для распараллеливания
Исследования предлагаемых вариантов распараллеливания и выбора из них наиболее предпочтительных
Пользователю предоставляются прогнозируемые характеристики эффективности (всей программы и ее отдельных циклов) для разных конфигураций интересующих его ЭВМ

Слайд 45

САПФОР:
анализ программы и прогноз
эффективности ее
параллельного выполнения

Скорректированная
исходная программа

FDVMH-компилятор

FDVMH-программа

Программа на PGI
Fortran CUDA

САПФОР: анализ программы и прогноз эффективности ее параллельного выполнения Скорректированная исходная программа
+
Lib-DVMH (MPI+CUDA)

Компиляторы
Fortran CUDA и C CUDA

Компилятор АРК-DVM

Последовательная
Фортран-программа

Кластер
с ГПУ

Схема использования DVMH-модели

Входная программа
для компилятора АРК-DVM

Слайд 46

Принципиальные решения

DVM-подход:
Программист принимает основные решения по распараллеливанию, а компилятор и система поддержки

Принципиальные решения DVM-подход: Программист принимает основные решения по распараллеливанию, а компилятор и
обеспечивают их реализацию
Спецификации параллелизма – это комментарии к последовательной программе
Автоматическое распараллеливание на кластер:
Подсказки пользователя о свойствах программы, выбор схемы распараллеливания посредством прогнозирования
Автоматизированное распараллеливание программ:
Автоматическое распараллеливание + взаимодействие с программистом на этапе выбора схемы распараллеливания

Слайд 47

План изложения

Модели и языки программирования с явным параллелизмом
Языки программирования с неявным

План изложения Модели и языки программирования с явным параллелизмом Языки программирования с
параллелизмом + автоматическое распараллеливание (НОРМА, Fortran, C, C++)
Автоматизация преобразования имеющихся последовательных программ в эффективные параллельные программы на языках с явным или неявным параллелизмом
Автоматизация отладки

Слайд 48

Автоматизация функциональной отладки параллельных программ
Автоматизированное сравнение поведения и промежуточных результатов разных версий

Автоматизация функциональной отладки параллельных программ Автоматизированное сравнение поведения и промежуточных результатов разных
последовательной программы
Динамический анализ корректности параллельной программы (автоматический)
Автоматическое сравнение поведения и промежуточных результатов параллельной и последовательной программ

Слайд 49

Функциональная отладка DVM-программ

Используется следующая методика поэтапной отладки программ:
На первом этапе программа

Функциональная отладка DVM-программ Используется следующая методика поэтапной отладки программ: На первом этапе
отлаживается на рабочей станции как последовательная программа, используя обычные методы и средства отладки
На втором этапе программа выполняется на той же рабочей станции в специальном режиме проверки распараллеливающих указаний
На третьем этапе программа выполняется на рабочей станции или на параллельной машине в специальном режиме, когда промежуточные результаты параллельного выполнения сравниваются с эталонными результатами (например, результатами последовательного выполнения)

Слайд 50

Типы ошибок

Синтаксические ошибки в DVM-указаниях и нарушение статической семантики
Неправильная последовательность выполнения

Типы ошибок Синтаксические ошибки в DVM-указаниях и нарушение статической семантики Неправильная последовательность
DVM-указаний или неправильные параметры указаний
Неправильное выполнение вычислений из-за некорректности DVM-указаний и ошибок, не проявляющихся при последовательном выполнении программы
Аварийное завершение параллельного выполнения программы (авосты, зацикливания, зависания) из-за ошибок, не проявляющихся при последовательном выполнении программы

Слайд 51

Динамический контроль

Чтение неинициализированных переменных
Выход за пределы массива
Необъявленная зависимость по данным в параллельной

Динамический контроль Чтение неинициализированных переменных Выход за пределы массива Необъявленная зависимость по
конструкции
Модификация в параллельной ветви размноженных переменных (не редукционных и не приватных)
Необъявленный доступ к нелокальным элементам распределенного массива
Чтение теневых граней распределенного массива до завершения операции их обновления
Использование редукционных переменных до завершения операции асинхронной редукции

Слайд 52

Сравнение результатов

Где и что сравнивать
Две трассы, одна трасса, без трасс – на

Сравнение результатов Где и что сравнивать Две трассы, одна трасса, без трасс
лету
Получение эталонной трассировки -
управление объемом при компиляции, через параметры запуска, с помощью файла конфигурации
Представительные витки циклов
Особенности сравнения (редукция, учет правила собственных вычислений, точность)

Слайд 53

Автоматизация отладки эффективности параллельных программ


Прогноз характеристик эффективности каждого варианта распараллеливания для разных

Автоматизация отладки эффективности параллельных программ Прогноз характеристик эффективности каждого варианта распараллеливания для
конфигураций интересующих пользователя ЭВМ
Прогноз характеристик эффективности полученной параллельной программы для разных конфигураций интересующих пользователя ЭВМ
Получение реальных характеристик эффективности параллельной программы при ее запусках на разных конфигурациях ЭВМ
Автоматическое сравнение прогнозируемых и реальных характеристик

Слайд 54

Эффективность выполнения параллельной программы

Эффективность выполнения параллельной программы выражается в ускорении вычислений, что

Эффективность выполнения параллельной программы Эффективность выполнения параллельной программы выражается в ускорении вычислений,
может привести:
к сокращению времени выполнения задачи фиксированного размера;
к росту размера задачи, которую удается решить за то же самое время.

Слайд 55

Критерии эффективности выполнения параллельных программ

Ускорение Sn = T1 / Tn, где Tn

Критерии эффективности выполнения параллельных программ Ускорение Sn = T1 / Tn, где
— время исполнения параллельной программы на n процессорах, T1 — время ее выполнения на 1-ом процессоре (или время выполнения исходной последовательной программы, или прогнозируемое время выполнения на 1 процессоре параллельной программы). В идеальном случае (отсутствие накладных расходов на организацию параллелизма), как может показаться, ускорение равно n (линейное ускорение).
Коэффициент эффективности Sn / n = T1 / nTn. В идеальном случае, как может показаться, он равен 1, или 100 %.

Слайд 56

Критерии эффективности выполнения параллельных программ

Если ускорение линейно от n, то говорят, что

Критерии эффективности выполнения параллельных программ Если ускорение линейно от n, то говорят,
такая программа обладает свойством масштабируемости (возможностью ускорения вычислений пропорционально числу процессоров).
Особое внимание заслуживает случай Sn > n (суперлинейное ускорение).
Требования исходной задачи могут превосходить возможности используемого процессора по его ресурсам (чаще всего это кеши различных уровней, буфер TLB, ОП). При запуске на нескольких процессорах на них попадают подзадачи меньшего объёма, и требования к объёму ресурсов процессора сокращаются. При преодолении таких порогов и возникает суперлинейное ускорение.

Слайд 57

Факторы, определяющие эффективность выполнения параллельных программ

степень распараллеливания программы - доля параллельных вычислений

Факторы, определяющие эффективность выполнения параллельных программ степень распараллеливания программы - доля параллельных
в общем объеме вычислений
равномерность загрузки процессоров во время выполнения параллельных вычислений
время ожидания межпроцессорных обменов (зависит от рассинхронизации процессов и степени совмещения межпроцессорных обменов с вычислениями)
эффективностью выполнения вычислений на каждом процессоре (кеш, подкачка страниц ВП, расходы на организацию параллелизма, выполнение процессором других программ)

Слайд 58

Характеристики эффективности параллельных программ

Пользователь может получить следующие характеристики эффективности программы и отдельных

Характеристики эффективности параллельных программ Пользователь может получить следующие характеристики эффективности программы и
ее частей:
execution time - астрономическое время выполнения
productive time - прогнозируемое время выполнения на одном процессоре
parallelization efficiency – прогнозируемая эффективность параллельного выполнения = productive time / (N * execution time)
lost time – потерянное время = N * execution time - productive time
где N - число процессоров

Слайд 59

Характеристики эффективности параллельных программ

Компоненты lost time:
insufficient parallelism - потери из-за выполнения

Характеристики эффективности параллельных программ Компоненты lost time: insufficient parallelism - потери из-за
последовательных частей программы на одном или всех процессорах
communication - потери из-за межпроцессорных обменов или синхронизаций
Idle time - простои процессоров из-за отсутствия работы
и важный компонент времени коммуникаций –
real synchronization - реальные потери из-за рассинхронизации

Слайд 60

Характеристики эффективности параллельных программ
Кроме того, выдаются характеристики:
load imbalance - возможные потери

Характеристики эффективности параллельных программ Кроме того, выдаются характеристики: load imbalance - возможные
из-за разной загрузки процессоров
synchronization - возможные потери на синхронизацию
time_variation - возможные потери из-за разброса времен
overlap - возможное сокращение коммуникационных расходов за счет совмещения межпроцессорных обменов с вычислениями

Слайд 61

Подходы к вычислению и выдаче характеристик
Как собирать
трассировка (для каждого процессора, каждой

Подходы к вычислению и выдаче характеристик Как собирать трассировка (для каждого процессора,
нити)
статистика
количество обращений * прогнозируемое время
Как выдавать
статистика по интервалам
статистика по конструкциям языка
временные диаграммы

Слайд 62

Проблема – нестабильность характеристик

Нестабильность коммуникаций
Изменение состава процессоров при неоднородности коммуникационной среды
Загрузка коммуникационной

Проблема – нестабильность характеристик Нестабильность коммуникаций Изменение состава процессоров при неоднородности коммуникационной
среды другими работами
Можно выдавать стабильные характеристики коммуникаций (вычислять их по формулам, зависящим от длин сообщений, латентности и пропускной способности коммуникационной среды)

Слайд 63

Нестабильность производительности процессоров


Попадание на медленные процессоры (появляется разбалансировка, можно запрашивать лишние процессоры

Нестабильность производительности процессоров Попадание на медленные процессоры (появляется разбалансировка, можно запрашивать лишние
и отключать медленные)
Частая активизация системных процессов (возрастает время коммуникаций за счет времени реальной рассинхронизации)
Можно моделировать не только коммуникации, но и загрузку процессоров
=> предсказание эффективности

Слайд 64

Предсказатель эффективности DVM-программ

получает характеристики выполнения DVM-программы на рабочей станции и использует их

Предсказатель эффективности DVM-программ получает характеристики выполнения DVM-программы на рабочей станции и использует
для предсказания эффективности ее выполнения на кластере с заданными параметрами (конфигурация, производительность процессоров, количество и характеристики каналов связи)
Для реализации такой схемы предсказания необходимо тщательное проектирование интерфейса с run-time системой

Слайд 65

Принципиальные трудности предсказания эффективности

Для современных процессоров трудно прогнозировать время выполнения разных

Принципиальные трудности предсказания эффективности Для современных процессоров трудно прогнозировать время выполнения разных
фрагментов программы (кэш-память и динамическое планирование выполнения)
Трудно моделировать работу программных компонентов коммуникационной системы
=> очень сложно получить точные характеристики выполнения программы

Слайд 66

Предсказатель – инструмент отладки эффективности

Он может довольно точно оценить влияние основных факторов:

Предсказатель – инструмент отладки эффективности Он может довольно точно оценить влияние основных

степень распараллеливания программы - доля параллельных вычислений в общем объеме вычислений
равномерность загрузки процессоров во время выполнения параллельных вычислений
время, необходимое для выполнения межпроцессорных обменов (и синхронизаций)
степень совмещения межпроцессорных обменов с вычислениями
=> есть еще важный фактор – эффективное выполнение вычислений на процессорах

Слайд 67

Предсказатель – инструмент отладки эффективности

На современных процессорах эффективность вычислений может отличаться в

Предсказатель – инструмент отладки эффективности На современных процессорах эффективность вычислений может отличаться
3-7 раз в зависимости от их согласованности с организацией кэш-памяти
Поэтому важно предоставить программисту инструмент, помогающий ему обеспечить такую согласованность.
Согласованность же с особенностями коммуникационных сетей (группировка или разбиение сообщений, их планирование) должны обеспечивать системы программирования с языков высокого уровня

Слайд 68

Выводы

Отладка эффективности параллельных программ – процесс очень сложный и трудоемкий
Развитые средства

Выводы Отладка эффективности параллельных программ – процесс очень сложный и трудоемкий Развитые
анализа эффективности могут существенно ускорить этот процесс
Из-за нестабильности характеристик эффективности при коллективном использовании параллельных ЭВМ важную роль могут сыграть средства предсказания этих характеристик посредством моделирования выполнения параллельных программ
Для достижения эффективности параллельной программы приходится многократно изменять программу, иногда кардинально меняя схему ее распараллеливания. Поэтому важно использовать высокоуровневые средства разработки параллельных программ

Слайд 69

Вопросы, замечания?
СПАСИБО !

Вопросы, замечания? СПАСИБО !
Имя файла: Автоматизация-разработки-параллельных-программ-для-современных-высокопроизводительных-ЭВМВ.А. КрюковФакультет-ВМК-МГУ,Инсти.pptx
Количество просмотров: 157
Количество скачиваний: 0