Биология в формате UltraHD

Эволюция
HD >>> Full HD >>> Ultra HD
От аналогового к цифровому
Разрешение

Секвенирование
От отдельных последовательностей до полных геномов всего за 30 лет!
Capillary Electrophoresis
Next Generation Sequencing
“Gold Standard”
1000 b.p. per run
3 days run
Revolution in molecular genetics
100 000 000 b.p. per run
Less then 24 hours for run
*https://en.wikipedia.org/wiki/DNA_sequencing

Цифровая революция

Ion Torrent
Rothberg J.M. et al Nature doi:10.1038/nature10242
Полупроводниковый чип
∆pH

К вопросу о разрешении…
Гомозиготта Гетерозиготта Минорный аллель
C/C
G/A
A/G (8%)
Порог детекции CE - 20% Порог детекции NGS<1%

Насколько безгранична ваша фантазия?
Один секвенатор
Один рабочий процесс
Три чипа
Множество задач!

Единый автоматизированный рабочий процесс

Клеточки

А что, если... каждая клетка уникальна ?
Ожидание
Реальность

Изучение экспрессии генов
Популяция в целом: 1.5х
Популяция В: 0х
Изменение уровня экспрессии
Популяция А: 1х
Популяция С: 4х

Работа с единичными клетками
Обогащение клеточной популяции
2. Изоляция отдельных клеток
3. Лизис, выделение нуклеиновых кислот
4. Амплификация
6. Секвенирование и анализ
5. Создание библиотеки секвенирования

Автоматическая хваталка-убивалка клеток C1

Протокол С1 Single-Cell

Приложения Single Cell

Профилирование клеточных популяций
Zeisel et al. Science Express (2015)
3005 клеток
9 классов
47 подклассов
Суспензия клеток ткани
Cоматосенсорная кора
Гиппокампус
Секвенирование мРНК единичных клеток
Человеческий мозг:
нейроны
олигодендроциты
астроциты
И многие другие?
Захват и процессирование клеток на системе С1

Определение клональной структуры опухоли
Амплификация полногеномной ДНК единичной клетки
Обогащение целевыми участками с потенциально важными мутациями

Вернёмся к нашим баранам
Телевидение изобрели в 1928 году
Секвенировать начали в 1977
Единичные клетки активно изучают меньше 10 лет
Что же будет дальше?

Single cell лаборатория от helicon
Сортер клеток S3e, Bio-Rad
Система С1, Fluidigm
Микроскоп ZOE, Bio-Rad
Секвенатор S5 XL, Thermo Fisher
Счетчик Countess II, Thermo Fisher
20-и летний опыт компании в организации ведущих лабораторий России

Thank you!
Let’s Do Science! ☺