Анаэробная инфекция. Лабораторная диагностика

Классификация

Анаэробная инфекция
Эндогенная инфекция
Предрасполагающие факторы
Диабет, коллагенозы, лейкопения
Лечение аминогликозидами, цитостатиками, стероидами
Повреждение барьеров (операции, травмы, инъекции, укусы)
Некроз
Злокачественные новообразования
Ассоциация микроорганизмов

Грамположительные анаэробные палочки

Грамположительные анаэробные палочки
(продолжение)

Грамположительные анаэробные кокки

Грамположительные анаэробные кокки
(продолжение)

Грамотрицательные анаэробные палочки

Грамотрицательные анаэробные палочки
(продолжение)

Грамотрицательные анаэробные кокки

Лабораторная диагностика
Анаэробная атмосфера
Анаэробная станция
Анаэростат
Готовая газовая смесь
Газогенераторные пакеты
10% H2+10%CO2+80%N2

Анаэробная станция BACTRON, производства Sheldon Manufacturing Inc., США
Рабочая зона
Инкубатор, вместимостью от 300 до 900 чашек Петри
Термоэлектрический осушитель
Катализатор
Герметичная система манжет
Шлюзовая камера

Анаэростаты
Готовая газовая смесь

Анаэростаты

Анаэробная система (Himedia)

Системы инкубации и генераторы атмосферы (bioMérieux)

Катализаторы и индикаторы анаэробиоза

Лабораторная диагностика
Материал, непригодный для исследования:
Отделяемое поверхностных ран, язв
Мазки из зева, носа, ротовой полости
Мазки из влагалища, цервикального канала
Мокрота, бронхиальные смывы
Моча
Содержимое желудка, тонкого и толстого кишечника
Фекалии

Лабораторная диагностика
Материал для исследования:
Кровь
Ликвор
Плевральная, перитонеальная, синовиальная жидкости
Гной из абсцессов и других закрытых полостей
Материалы из глубоких отделов свища
Фрагменты костной и мышечной ткани размером 1х1 см, взятые из глубокого очага воспаления во время операции

Лабораторная диагностика
Транспортировка материала
Тупферы с транспортной средой
Флаконы с жидкой питательной средой, заполненные газовой смесью
В шприце, с предварительно удаленным из него воздухом с загнутой под углом иглой или воткнутой в стерильную резиновую пробку (в данном случае материал доставляется в лабораторию немедленно)

Лабораторная диагностика
Транспортные среды
Amies
Cary-Blair
Тиогликолевая среда «СКС-199»
(33,0 г среды СКС растворяют в 1 л дистил-лированной воды, стерилизуют при 1 атм в течение 20 мин. Затем в стерильных условиях к 900 мл свежеприготовленной СКС добавляют 100 мл среды 199 для культур клеток, и, размешав, разливают в пробирки высоким столбиком (по 10-12 мл). Хранят среду в холодильнике)

Влияние сроков транспортировки материала на высеваемость микроорганизмов

Лабораторная диагностика
Тупферы с транспортной средой

Лабораторная диагностика
Питательные среды
Обогатительные среды:
СКС
Среда Китт-Тароцци
Плотные питательные среды общего назначения:
Brucella, Columbia, Schaedler и другие обогащенные среды с добавлением 5% дефибринированной крови барана, витамина К (10 мкг/мл) и гемина (5мкг/мл)
Селективные среды:
PEA (агар с фенилэтиловым спиртом)
BBE (желче-эскулиновый агар для бактероидов)
KVLB (кровяной агар с канамицином и ванкомицином)

Лабораторная диагностика
Характеристика питательных сред

Лабораторная диагностика
Диски с антибиотиками для идентификации

Лабораторная диагностика
Ориентировочная идентификация

Лабораторная диагностика
Идентификация
Биохимическая
Газожидкостная хроматография
MALDI-TOF масс спектрометрия

Тест-системы для биохимической идентификации анаэробов

Тест-системы для биохимической идентификации анаэробов

Определение чувствительности к антибактериальным препаратам
Метод серийных разведений. Стандарты.
CLSI
EUCAST
Диско-диффузионный метод???

Prevotella melaninogenica
Porphyromonas gingivalis

Prevotella melaninogenica

Propionibacterium spp.
Peptostreptococcus spp.
Prevotella spp.
Fusobacterium spp.

Bacteroides vulgatus

Bacteroides levii
рост на Бруцелл агаре с гемином и витамином К1

Fusobacterium spp.
F.nucleatum
F.nucleatum
F.necrophorum
F.mortiferum

Fusobacterium spp.

Fusobacterium necrophorum

Fusobacterium necrophorum

Fusobacterium periodenticola

Leptotrichia buccalis

Bacteroides thetaiotamicron

Porphyromonas gingivalis

Prevotella corpis

Anaerobaculum mobile

B.fragilis

колистин
канамицин
ванкомицин

B.fragilis

B.fragilis

Actinomyces spp.

Eubacterium rectale

Bifidobacterium
Bifidobacterium spp.

P.anaerobius

Veillonella spp.

Clostridium perfringens
Рост на КА
Окраска по Граму

C.novyi

C.septicum

C.septicum

C.ramosum

C.sporogenes

C.sordelii
ФА

C.sordelii

Clostridium difficile
Лабораторная диагностика
Бактериологический метод (КА, CCFA)
Экспресс методы :
ИФА (токсины А/В, глутаматдегидрогеназа)
Иммунохроматография
ПЦР

Clostridium difficile
Лабораторная диагностика
Рост на ССFA
(циклосерин-цефокситин-фруктоза агар)
Люминисценция на CCFA при УФ

Clostridium difficile
Лабораторная диагностика
Иммуноферментный анализ
Метод иммунохроматографии

Нормативные документы
ГОСТ 26503-85
Государственный стандарт Союза ССР. Животные сельскохозяйственные. Методы лабораторной диагностики клостридиозов.
ГОСТ 10444.9-88
Государственный стандарт Союза ССР. Продукты пищевые. Метод определения Clostridium perfringens.
ГОСТ 31744-2012
Микробиология пищевых продуктов и кормов для животных. Метод подсчета колоний Clostridium perfringens.