L_7_5_s__Respiratornye_virusy (1)

План лекции:
Классификация возбудителей ОРВИ, общая характеристика инфекций.
Таксономия, морфология, химический состав, антигены вируса гриппа. Репродукция вируса.
Эпидемиология, патогенез, клиника гриппозной инфекции
Лабораторная диагностика и специфическая профилактика гриппа.
Таксономия и морфология SARS-CoV2.
Патогенез, клиника, лабораторная диагностика COVID-19.
Специфическая профилактика COVID-19.

ВОЗБУДИТЕЛИ ОРВИ
Orthomyxoviridae (вирусы гриппа А, В, С)
Paramyxoviridae (ВПГЧ,RS – вирус);
Coronaviridae
Reoviridae
Picornaviridae (риновирусы, вирусы Коксаки, ECHO)
Adenoviridae

Проявления ОРВИ
ОРВИ
Верхнего отдела Нижнего отдела
респираторного тракта респираторного тракта
Ринит (рино и коронавирусы), Бронхит и бронхиолит
фарингит (корона, парамиксо, (РС –вирусы)
аденовирусы) пневмонии (гриппа,
парагриппа)

Структура возбудителей ОРВИ

Вирусы гриппа

Этимология
Грипп – франц. Grippe – хватать заразный насморк
Инфлюэнца – итал. Influentia – влияние энергии звезд

Таксономия
Семейство Orthomyxoviridae
Род Alphainfluenzavirus (тип А)
Род Betainfluenzavirus (тип В)
Род Gammainfluenzavirus (тип С)
Род Deltainfluenzavirus (тип D)
Деление на типы осуществляют по АГ рибонуклеопротеина

Ортомиксовирусы:
структура вириона
сердцевина (нуклеокапсид спиральной симметрии)
Минус РНК линейная, однонитевая ( А и В – 8, С – 7)
4 структурных белка
3 неструктурных белка (ферменты)
суперкапсид
М-белок (М1; М2 –трансмембранный)
билипидный слой
шипы (гликопротеины – gp)
гемагглютинин (Н) – тример
нейраминидаза (N) – тетрамер

Внутренние белки
Неструктурные
Белок Р1 – фермент РНК-полимераза для репликации
Белок Р2 – помогает Р1 копировать с геномной РНК транскрипты;
Белок Р3 – фермент эндонуклеаза для «откусывания» от клеточных и-РНК «шапочек»;
Структурные
Белок NP – внутренний белок, связанный с геномом, типоспецифический АГ (определяется в РСК);
Белок М – стабилизирует вирусную частицу; при недостатке или его отсутствии вирусная частица распадается

Поверхностные белки (гликопротеины)
Гемагглютинин –
Состоит из глобулы и стебля
Является специфическим АГ
Определяет подтип вируса
Вызывает образование протективных АТ;
Агглютинирует эритроциты кур, морских свинок, человека
Высокоизменчивый АГ (дрейф и шифт)
Определяют в РТГА

Поверхностные белки (гликопротеины)
Нейраминидаза (фермент)
Участвует в проникновении вириона в клетку и его выходе из клетки
АТ против нейраминидазы только частично нейтрализуют вирус

Отличия вирусов гриппа типа А, В, С

Циркуляция вирусов гриппа и заболеваемость на 16.09.22 (ВОЗ)

ГСЭГО — глобальная система эпиднадзора за гриппом и ответных мер - это проверенная глобальная сеть, которая уже 70 лет обеспечивает первую линию защиты от гриппа (организована в 1952 году)

Когда в 1952 г. была создана ГСЭГО, только 25 стран имели какой-либо эпиднадзор за гриппом и могли представлять данные в ВОЗ.
По состоянию на январь 2022 г. ГСЭГО расширилась и теперь включает 148 национальных центров по гриппу (НЦГ), семь сотрудничающих центров ВОЗ (СЦ), четыре основных контрольных лаборатории и 13 референс-лабораторий по H5.
ГСЭГО:

тип;
место выделения (географическое происхождение штамма);
индекс, присвоенный в лаборатории (порядковый номер штамма);
год выделения;
(только для вирусов животных) название животного, являющегося естественным хозяином вируса (от которого выделен вирус).
индекс поверхностных белков, ставится последним и заключается в скобки, имеет смысл только для вируса типа «A»;
Спецификация наименования штамма вируса гриппа (ВОЗ)

Схема реассортации вирусов гриппа А человека и птиц

Серотипы вируса гриппа А
(по классификации ВОЗ 1980 г.)

Устойчивость вирусов гриппа

Репродукция вируса
Связывание гемагглютинина с рецепторами клетки
Проникновение в клетку эндоцитозом (белки клатрины);
Слияние фагосомы с лизосомой;
Раздевание, выход нуклеокапсида в цитоплазму;
Вместе с М белком транспортируется в ядро;
С геномной РНК под действием Р1 и Р2 копируются транскриптанты 2-х видов: полные и неполные плюс РНК;
Неполные (укороченные) нити «дорабатываются» Р3, т.е. к 5´ концу присоединяется «шапочка», а к 3´ концу – полиА последовательность;
Синтез белков с неполных плюс РНК (структурных и неструктурных)
Полные копии становятся матрицей для синтеза репликативной РНК;
Сборка вируса и выход из клетки (почкование);

Репликация и транскрипция
-РНК
(Вирусная РНК-полимераза)
Неполные +РНК Полные +РНК
Белок -РНК нити

Выход из клетки вирусов гриппа

Эпидемиология гриппа
Аэрогенный механизм заражения
Пути передачи:
воздушно-капельный
контактный
Ворота инфекции – респираторный тракт, слизистая глаз

Экспресс – диагностика гриппа (на 3-5 день)
Материал: слизь из носа и носоглотки, мазки-отпечатки с нижних носовых ходов
Обнаружение АГ с помощью РИФ, ИФА, РТГА
Обнаружение РНК вируса с помощью ОТ-ПЦР

Ретроспективная диагностика гриппа
1. Вирусологический метод (первые дни)
носоглоточный смыв
⇓
куриный эмбрион, клеточные культуры
⇓
РГА, РГадс– индикация
⇓
РСК – тип
РТГА - подтип
2. Серологический метод
антитела в «парных сыворотках» (ч/з 8-14 дней) – РСК, РТГА

Специфическая профилактика гриппа
1 поколение (цельновирионные вакцины) - живые и инактивированные
2 поколение (сплит вакцины)-расщепленные, содержат внутренние и наружные АГ без липидов суперкапсида: Ваксигрипп, Бегривак.
3 поколение – (субъединичные) содержат только наружные H N антигены: Инфлювак, Агриппал S1
4 поколение – (субъединичные адъювантные) содержат высокоочищенные поверхностные белки и иммуноадъювант: Гриппол

В сезоне 2021-2022 будет циркулировать четыре типа вируса: тип A/Victoria/2570/2019 (H1N1)pdm09; тип A/Cambodia/e0826360/2020 (H3N2); тип B/Washington/02/2019; тип B/Phuket/3073/2013 (этот штамм рекомендован для четырехвалентной вакцины).
Источник: https://medvisor.ru/articles/privivki/sostav-privivki-ot-grippa/
В сезоне 2021-2022 будет циркулировать четыре типа вируса:
тип A/Victoria/2570/2019 (H1N1)pdm09; тип A/Cambodia/e0826360/2020 (H3N2); тип B/Washington/02/2019;
тип B/Phuket/3073/2013 (этот штамм рекомендован для четырехвалентной вакцины).
По данным ВОЗ

Состав трех и четырехвалентных вакцин в 2022 г.
Совигрипп
H A (H1N1) – 5 мкг
H A (H3N2) – 5 мкг
H B - 1 мкг
СОВИДОН - 500 мкг
Тиомерсал – 50 мкг
Фосфатно-солевой буфер
Ультрикс Квадри
H A (H1N1) – 15 мкг
H A (H3N2) – 15 мкг
H B линия Yamagata -15 мкг
H B линия Victoria - 15 мкг
Полисорбат 80 - 250 мкг
Октосинол 10 - 150 мкг
Фосфатно-солевой буфер

Группы риска, подлежащие вакцинации (рекомендации ВОЗ)
ВОЗ рекомендует ежегодную вакцинацию для следующих групп населения:
беременные женщины на любом сроке беременности
дети в возрасте от 6 месяцев до 5 лет
пожилые люди (старше 65 лет)
люди с хроническими нарушениями здоровья
работники здравоохранения.
беременные женщины на любом сроке беременности
дети в возрасте от 6 месяцев до 5 лет
пожилые люди (старше 65 лет)
люди с хроническими нарушениями здоровья
работники здравоохранения.

Принципы лечения гриппа
Препараты интерферона (Виферон, интерферон лейкоцитарный, Гриппферон)
Противовирусные препараты
Индукторы интерферферона (Арбидол, Амиксин, Циклоферон)
Противогриппозный иммуноглобулин

Противовирусные препараты

Семейство Coronaviridae

Таксономия коронавирусов:
Царство: Vira
Семейство: Coronaviridae (46 вирусов)
Подсемейства: Letovirinae (3 рода)
Orthocoronavirinae
Род: Alphacoronavirus,
Betacoronavirus,
Gammacoronavirus,
Deltacoronavirus)

7 коронавирусов, поражающих человека

Филогения коронавирусов
Филогенетический анализ подтвердил принадлежность SARS-CoV-2 к той же кладе коронавирусов, что и MERS-CoV, SARS-CoV, SARS-CoV-подобных вирусов летучих мышей, при наибольшем сходстве с последними и наименьшем — с MERS-CoV.

Коронавирусы: строение
Сложноорганизованные размером 80-220 нм
Спиральный тип симметрии
Геном - однонитевая несегментированная плюс РНК
М-белок – мембранный протеин
Гликопротеины (пепломеры):
S («Spike» трансмембранный тример),
Е (малый оболочечный протеин),
HE (гемагглютинин-эстераза-димер)

Особенности репродукции SARS-CoV-2
SARS-CoV-2 использует S-белок на короне для прикрепления к своему рецептору – ангиотензинпревращающему ферменту 2 (АСЕ 2), также к сериновой протеазе TMPRSS2

Экспрессия АПФ 2 (ACE2)
Пневмоциты,
Энтероциты,
Эндотелиальные клетки артерий и вен,
Гладкие мышцы,
Кора головного мозга, полосатое тело, ствол мозга, глия (потеря обоняния и вкуса)
При подавлении АПФ 2 накапливаются ангиотензин и брадикинин, что ведет к респираторному дистресс-синдрому, отеку легких и миокардиту

Репродукция коронавирусов
Проникновение путем эндоцитоза, высвобождение вирусной РНК
Трансляция полипротеина на +РНК и ее протеолиз- образование РНК-полимеразы.
Синтез на +РНК двух нитей –РНК (1-матрица для синтеза нового генома, 2- и-РНК)
Синтез новых вирусных +РНК и структурных белков, сборка вируса.
Выход путем экзоцитоза.

Схема репродукции коронавирусов

Эпидемиология коронавирусной инфекции
Зооантропонозная инфекция
Источники- больные люди и животные (млекопитающие и птицы).
SARS-CoV - циветы
MERS-CoV – одногорбые верблюды
SARS-CoV-2 – подковоносные летучие мыши? Панголины?
Пути заражения:
Воздушно-капельный, контактно-бытовой, воздушно-пылевой, алиментарный

Основные симптомы COVID-19
(инкубационный период 2-14 суток)

Осложнения COVID-19
Острая дыхательная недостаточность,
Острый респираторный дистресс-синдром,
Тромбоэмболия легочной артерии,
Сепсис,
Шок
У беременных: дистресс плода, выкидыш,
преждевременные роды

Диагностика COVID-19
Временные методические рекомендации «Профилактика, диагностика и лечение новой коронавирусной инфекции» (COVID-19)
Версия 16 (18.08.2022)

Этиологическая диагностика: материал
мазок из носоглотки и ротоглотки,
мокрота,
эндотрахеальный аспират
бронхоальвеолярный лаваж (если пациент на ИВЛ)
другие материалы: кровь (сыворотка, цельная кровь), моча
До момента транспортировки, взятые образцы необходимо хранить в холодильнике, при температурном режиме от 2 до 4 градусов

Методы исследования
Выявление вирусных РНК SARS-CoV-2 методом амплификации (ОТ-ПЦР-РВ)
Выявление вирусных антигенов иммунохроматографическими методами.
Выявление иммуноглобулинов А, M и G к SARS-CoV-2 (ИФА) – непрямой метод.

Определение антител – иммунохимическим методом
Ig A – со 2 дня и сохраняются 2 недели
Ig M – через 7 дней от момента заражения, сохраняются 2 месяца.
Ig G – с 3 недели.
К иммунохимическим относятся методы иммуноферментного анализа (ИФА), иммунохемилюминесценции (ИХЛ) и иммунохроматографии.

Специфическая профилактика COVID-19
Комбинированная векторная вакцина («Гам-КОВИД-Вак», раствор для внутримышечного введения), дата регистрации 11.08.2020 г.;
комбинированная векторная вакцина («Гам-КОВИД-Вак-Лио»), дата регистрации 25.08.2020 г.;
вакцина на основе пептидных антигенов («ЭпиВакКорона»), дата регистрации 13.10.2020 г.;
вакцина коронавирусная инактивированная цельновирионная концентрированная очищенная («КовиВак»), дата регистрации 19.02.2021 г.;
вакцина для профилактики COVID-19 («Спутник Лайт»), дата регистрации 06.05.2021 г.;
вакцина на основе пептидных антигенов («АВРОРА-КоВ»), дата регистрации 26.08.2021 г., дата переоформления 12.04.2022 г.;
комбинированная векторная вакцина («Гам-КОВИД-Вак-М»), дата регистрации 24.11.2021.
Вакцина субъединичная рекомбинантная («Конвасэл»), дата регистрации 18.03.2022 г.;
Комбинированная векторная вакцина («Гам-КОВИД-Вак», капли назальные), дата регистрации 31.03.2022 г.
Комбинированная векторная вакцина («Салнавак»), дата регистрации 04.07.2022 г

Контрольные вопросы:
Вирусы каких семейств вызывают ОРВИ?
По каким признакам вирус гриппа типа А отличаются от других вирусов гриппа?
Какова антигенная структура вирусов гриппа, в каких реакциях определяют антигенную структуру вирусов гриппа?
Механизмы антигенной изменчивости вирусов гриппа?
Как проводят экспресс и ретроспективную диагностику гриппозной инфекции?
Группы вакцин, применяемых при гриппе, их достоинства и недостатки.
Морфология и медицинская роль коронавирусов.
Какие рецепторы использует коронавирус для адсорбции на клетках эпителия?
Какие методы диагностики используются при COVID-19?