Не все в долонях ДНК: епігенетика та імунні клітини

Метилювання ДНК
Модифікація гістонів
Ремоделювання хроматину
Пріони
мікроРНК
Епігенетика

В-лімфоцити
Bruna Barneda-Zahonero “Epigenetic Regulation of B Lymphocyte Differentiation, Transdifferentiation, and Reprogramming”
2012

1.
Клітина попередник лімфопоезу: для перетворення в В-лімфоцити мають подіяти транскрипційні фактори - ikaros та PU.
2.
Рання «спеціалізація»: E2A, EBF, and FOXO1 ( а саме реанжерування генів V(D)J).
3.
Фактори репресії транскрипції Bcl6 and Blimp-1 мають місце в перетворенні в плазматичні клітини.

E47 DNA binding alters the pattern of H3K4 monomethylation. (a) Forced E47 expression in E2A-deficient pre-pro-B cells promotes the establishment of a bimodal distribution of H3K4me1 centered across E2A occupancy. E2A-deficient pre-pro-B cells were transduced with virus carrying the full-length coding DNA sequence of E47 fused to the estrogen receptor domain (E47ER). As a control, cells were transduced with virus expressing the E47 bHLH domain fused to the ER domain (bHLHER). Twenty-one hours post infection, cells were incubated with tamoxifen to induce E47 activity for either one or six hours, harvested, formaldehyde cross-linked, immunoprecipitated with an anti-E2A or anti-H3K4me1 antibody, and analyzed by ChIP-Seq. X-axis shows the genomic distance from E2A bound regions. Y-axis shows the individual immunoprecipitated mapped reads (or tags) per base pair. (b) Forced E47 expression in E2A-deficient T cells promotes the establishment of a bimodal distribution of H3K4me1 centered across E2A occupancy. E2A-deficient A12 cells were transduced with virus and analyzed by ChIP-Seq as described above.

Т-лімфоцити
Brendan E. Russ: «T cell immunity as a tool for studying epigenetic regulation of cellular differentiation»
2013