Слайд 2Природа сил взаимодействия
Вандерваальсовы взаимодействия
а) Кезом - ориентационный эффект - диполь-дипольное взаимодействие
![Природа сил взаимодействия Вандерваальсовы взаимодействия а) Кезом - ориентационный эффект - диполь-дипольное](/_ipx/f_webp&q_80&fit_contain&s_1440x1080/imagesDir/jpg/1170690/slide-1.jpg)
Uор. = -2p12p22/3kTr6
б) Дебай - индукционный эффект - диполь-индуцированный диполь
Uиндукц. = -1/2 (aE2) = -2ap2/r6
в) Лондон -дисперсионный эффект - взаимодействие мгновенных диполей
Uдисп. = -ѕ(h/2π)ω0(e4/k2r6) = -ѕ(h/2π)ω0(a2/r6)
Водородные связи
Ионные взаимодействия
Гидрофобные взаимодействия
Слайд 3Типы взаимодействий с участием ароматических систем
Parallel aromatic
interaction
Perpendicular
aromatic interaction
CH–π
Cation– π
![Типы взаимодействий с участием ароматических систем Parallel aromatic interaction Perpendicular aromatic interaction CH–π Cation– π](/_ipx/f_webp&q_80&fit_contain&s_1440x1080/imagesDir/jpg/1170690/slide-2.jpg)
Слайд 5Конкурентный
равновесный диализ
![Конкурентный равновесный диализ](/_ipx/f_webp&q_80&fit_contain&s_1440x1080/imagesDir/jpg/1170690/slide-4.jpg)
Слайд 6Гидродинамические методы
Вискозиметрия
а) Связь характеристической вязкости с макромолекулярными параметрами для разных моделей
![Гидродинамические методы Вискозиметрия а) Связь характеристической вязкости с макромолекулярными параметрами для разных](/_ipx/f_webp&q_80&fit_contain&s_1440x1080/imagesDir/jpg/1170690/slide-5.jpg)
б) Изменение этих параметров в зависимости от способа связывания макромолекулы (ДНК) с лигандом
Динамическое двойное лучепреломление
а) Определение термодинамической жесткости макромолекулы
б) Изменение термодинамической жесткости и оптической анизотропии макромолекулы (ДНК) при связывании с лигандами
Слайд 7Соотношение Сведберга
Аналитическое центрифугирование
Эксперимент: определение скорости, с которой
концентрационная граница движется в гравитационном
![Соотношение Сведберга Аналитическое центрифугирование Эксперимент: определение скорости, с которой концентрационная граница движется в гравитационном поле](/_ipx/f_webp&q_80&fit_contain&s_1440x1080/imagesDir/jpg/1170690/slide-6.jpg)
поле
Слайд 8Обработка результатов аналитического центрифугирования
Соотношение Ламма –
диф. уравнение второго порядка,
решение которого
![Обработка результатов аналитического центрифугирования Соотношение Ламма – диф. уравнение второго порядка, решение](/_ipx/f_webp&q_80&fit_contain&s_1440x1080/imagesDir/jpg/1170690/slide-7.jpg)
дает коэф.
диффузии и гидродинамический
радиус молекулы
Слайд 9Результат обработки данных с помощью
соотношения Ламма
Получение седиментационного профиля трансформацией
сканирующих профилей
![Результат обработки данных с помощью соотношения Ламма Получение седиментационного профиля трансформацией сканирующих профилей](/_ipx/f_webp&q_80&fit_contain&s_1440x1080/imagesDir/jpg/1170690/slide-8.jpg)
Слайд 10Седиментация (продолжение)
Достижения, позволившие расширить возможности метода
а) создание программ по численному решению соотношения
![Седиментация (продолжение) Достижения, позволившие расширить возможности метода а) создание программ по численному](/_ipx/f_webp&q_80&fit_contain&s_1440x1080/imagesDir/jpg/1170690/slide-9.jpg)
Ламма с получением в одном эксперименте всех параметров
б) отфильтровывание всех стохастических и систематических ошибок в процессе решения
в) введение флюоресцентной детекции
Слайд 11Гель-электрофорез с градиентом
температуры
![Гель-электрофорез с градиентом температуры](/_ipx/f_webp&q_80&fit_contain&s_1440x1080/imagesDir/jpg/1170690/slide-10.jpg)
Слайд 12Плазмидная ДНК в атомном силовом микроскопе
![Плазмидная ДНК в атомном силовом микроскопе](/_ipx/f_webp&q_80&fit_contain&s_1440x1080/imagesDir/jpg/1170690/slide-11.jpg)
Слайд 14Способы создания многозарядных ионов
![Способы создания многозарядных ионов](/_ipx/f_webp&q_80&fit_contain&s_1440x1080/imagesDir/jpg/1170690/slide-13.jpg)
Слайд 15Схематическое представление процесса образования
заряженных каплей раствора ДНК в ацетате аммония
(отрицательная
![Схематическое представление процесса образования заряженных каплей раствора ДНК в ацетате аммония (отрицательная и положительная моды)](/_ipx/f_webp&q_80&fit_contain&s_1440x1080/imagesDir/jpg/1170690/slide-14.jpg)
и положительная моды)
Слайд 16Полные спектры ESI-MS дуплекса d(CGCGAATTCGCG)2
с дауномицином, доксорубицином и бромистым этидием
в отрицательной
![Полные спектры ESI-MS дуплекса d(CGCGAATTCGCG)2 с дауномицином, доксорубицином и бромистым этидием в](/_ipx/f_webp&q_80&fit_contain&s_1440x1080/imagesDir/jpg/1170690/slide-15.jpg)
(верх) и положительной (низ) моде
Слайд 18Образование 10-компонентного белкового
комплекса с кофакторами и лигандами (а)
Диссоциация мультипротеинового комплекса (b)
![Образование 10-компонентного белкового комплекса с кофакторами и лигандами (а) Диссоциация мультипротеинового комплекса (b)](/_ipx/f_webp&q_80&fit_contain&s_1440x1080/imagesDir/jpg/1170690/slide-17.jpg)
Слайд 21Примеры рентгенограмм (дифракционных картин)
Белок
ДНК-порфирин
![Примеры рентгенограмм (дифракционных картин) Белок ДНК-порфирин](/_ipx/f_webp&q_80&fit_contain&s_1440x1080/imagesDir/jpg/1170690/slide-20.jpg)
Слайд 23Процесс определения структуры белка по дифракции на одиночном кристалле и использованию явления
![Процесс определения структуры белка по дифракции на одиночном кристалле и использованию явления аномального рассеяния](/_ipx/f_webp&q_80&fit_contain&s_1440x1080/imagesDir/jpg/1170690/slide-22.jpg)
аномального рассеяния
Слайд 24Пример модели, вписанной в карту электронной плотности
![Пример модели, вписанной в карту электронной плотности](/_ipx/f_webp&q_80&fit_contain&s_1440x1080/imagesDir/jpg/1170690/slide-23.jpg)
Слайд 25Кристаллическая структура комплекса ДНК-актиномицинD
![Кристаллическая структура комплекса ДНК-актиномицинD](/_ipx/f_webp&q_80&fit_contain&s_1440x1080/imagesDir/jpg/1170690/slide-24.jpg)