Methoden der Krebsforschung zur Identifikation von Onkogenen

Inhalt
Zusammenfassung des Artikels „Cancer and Genomics“
Erläuterung von Forschungsmethoden aus dem Jahre 2001 und davor
Definition von CRISPR/Cas9
CRISPR/Cas9 als Werkzeug der Gentechnik
Beispiele der Anwendung
Fazit

Cancer and Genomics
Was sind Onkogene?
Was sind „paralogues“?
im Artikel angewandte Forschungsmethoden:
Gen-Mapping
paraloge Gene
„draft genome“

https://cancer.sanger.ac.uk/census#cl_overview

CRISPR/Cas9 (1)
Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats
Was ist das CRISPR/Cas9 – System?
Funktionsweise
Anwendung in der Forschung

Oben: CRISPR-RNA mit einem komplementären Abschnitt
Unten: tracr-RNA
CRISPR/Cas9 (2)
https://www.youtube.com/watch?v=ouXrsr7U8WI

CRISPR/Cas9 (3)
Verbindung der CRISPR- und tracr-RNA mit dem Cas9-Protein
https://www.youtube.com/watch?v=ouXrsr7U8WI

Anlagerung der CRISPR-RNA an die komplementäre Sequenz
Bestimmung der Schnittstelle
CRISPR/Cas9 (4)
https://www.youtube.com/watch?v=ouXrsr7U8WI

Fusionierung der CRISPR- und tracr-RNA
CRISPR/Cas9 (5)
https://www.youtube.com/watch?v=ouXrsr7U8WI

CRISPR/Cas9 (6)
Wiederaufbau des DNA-Strangs
https://www.youtube.com/watch?v=ouXrsr7U8WI

CRISPR/Cas9 als Werkzeug der Gentechnik
Fusion von CRISPR- und tracr-RNA
Genausschaltung (gezieltes „knock-out“)
Anwendung in der Krebsforschung

CRISPR/Cas9 als Werkzeug der Gentechnik
„Drop-out Screens“ = „Loss of function – Experimente“
shRNA = small hairpin RNA
Quelle: https://www.vitascientific.com/news/article/using-dropout-screens-to-better-understand-breast-cancer?cpath=22

Fazit
Im Artikel genannte Methoden haben ihre Schwächen
Es wird immer schwieriger neue Onkogene zu finden
CRISPR/Cas9 etabliert sich als neue Technik in der Krebsforschung